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为探究 αβ T 细胞受体(TCR)与主要组织相容性复合体(MHC)分子的结合机制,研究人员开展了关于 TCR 与 HLA-DQ2 分子结合模式的研究。结果发现一种 TRAV12-1+-TRBV5-1+ G9 TCR 能以肽无关的方式结合 HLA-DQ2.5,这一发现重塑了对 TCR 结合模式的认知。
在免疫领域的研究中,T 细胞受体(TCR)与主要组织相容性复合体(MHC)分子的相互作用一直是科学家们关注的焦点。长久以来,αβ T 细胞受体共识别由 MHC 分子呈递的肽抗原,这一理论是 T 细胞介导免疫反应的核心教条。大量的结构和功能研究表明,TCR 通常以 “端对端” 的方式结合在 MHC 抗原结合槽上方,同时与肽抗原和 MHC 分子相互作用。然而,随着研究的深入,一些特殊的结合模式逐渐被发现,如反向对接极性模式,但这些模式仍遵循与肽 - MHC 分子特异性相互作用的原则。
在此背景下,来自莫纳什大学(Monash University)、沃尔特和伊丽莎?霍尔研究所(The Walter and Eliza Hall Institute)等机构的研究人员开展了一项意义重大的研究。他们旨在探索 TCR 与 MHC 分子结合的更多可能性,以及这些结合模式对 T 细胞功能的影响。该研究成果发表在《Nature Communications》上,为深入理解 T 细胞免疫机制提供了新的视角。
研究人员采用了多种关键技术方法。在样本获取方面,从患有乳糜泻的 HLA-DQ2.5 纯合子供者外周血中分离 CD4+ T 细胞。利用四聚体磁富集和单细胞索引分选技术筛选与 HLA-DQ2.5 四聚体结合的 T 细胞。通过表面等离子共振(SPR)技术测定 TCR 与 pHLA 的稳态结合亲和力。运用 X 射线晶体学技术解析 TCR - HLA-DQ2 复合物的晶体结构,以明确其结合模式的结构基础 。
下面来看具体的研究结果:
- 发现肽无关的 CD4+ T 细胞:研究人员从供者外周血中分离出与 HLA-DQ2.5 四聚体结合的 CD4+ T 细胞,经检测发现,TRAV12-1+-TRBV5-1+ G9 TCR 能与 HLA-DQ2.5 四聚体结合,且结合模式与肽无关,而其他测试的 TCR 未显示出这种特性。通过 SPR 分析,G9 TCR 对不同肽结合的 HLA-DQ2.5 以及 HLA-DQ2.2 都具有相似的亲和力,进一步证实了其肽无关的结合模式。
- G9 TCR - 肽 - HLA-DQ2 相互作用的结构基础:研究人员解析了 G9 TCR 与 HLA-DQ2.5glia-ω1、HLA-DQ2.5CLIP和 HLA-DQ2.2 复合物的晶体结构。结果显示,G9 TCR 结合在 HLA-DQ2 β 链的 β1 区域,远离肽抗原结合槽。G9 TCR 的 CDR1α、CDR3α、CDR2β 和 CDR3β 环与 HLA-DQ2.5β 链形成特异性接触,而不与 HLA-DQ2.5α 链和肽接触。
- G9 TCR 与 HLA-DQ2 结合的能量基础:基于晶体结构,研究人员对 G9 TCR 进行了 15 个单点丙氨酸扫描突变,并利用 SPR 分析突变对其与 HLA-DQ2 结合的影响。结果发现,CDR1α - Gln37、FWα - Arg82、CDR3α - Phe109 等残基对结合具有关键作用,这些残基形成的核心热点区域对 G9 TCR - HLA-DQ2 的识别至关重要。
- G9 TCR - HLA-DQ2 识别的非典型结合模式:以往研究将 TCR 识别模式分为经典和反向极性对接,而 G9 TCR 与 HLA-DQ2 的结合呈现出一种新的模式。其 Vα 和 Vβ 以反向极性模式(~180°)并以极端角度(~110°)结合在 HLA-DQ2glia-ω1的 β1 区域,形成 “端对侧” 的识别模式,与目前已知的 αβTCR - pMHC 结构均不同。
- HLA-DQ2β 中的 Glu46和 Leu55决定 G9 TCR 特异性:通过对 180 种 HLA - I 类和 II 类分子的高通量 Luminex 筛选,发现 G9 TCR 特异性结合所有 HLA-DQ2 分子,而不结合其他 HLA 分子。对 HLA-DQ2 分子进行突变分析,确定了 Glu46和 Leu55在 G9 TCR 与 HLA-DQ2 结合特异性中起关键作用。
- G9 TCR 与 HLA-DQ2 结合不激活 T 细胞信号传导:研究人员将 G9 TCR 稳定表达在 T 细胞系中,发现与对照 G2-TCR 不同,G9 TCR 与 HLA-DQ2.5 结合后,不会激活 CD69 T 细胞信号通路。进一步研究表明,G9 TCR 与 HLA-DQ2 结合时会干扰 CD4 的结合,从而抑制 T 细胞激活。
研究结论和讨论部分指出,该研究发现了 αβTCR - pMHC 的一种意外结合模式,TRAV12-1+-TRBV5-1+ G9 TCR 以反向极性但位于 HLA-DQ2 β 链侧面的方式结合,远离肽结合槽,形成 “端对侧” 识别,且结合与肽无关,展现出类似抗体的结合特性。这一发现与 γδTCR - 配体 - MHC 样结构中的对接拓扑结构相似,拓展了对 TCR 结合模式的认知。同时,研究还揭示了 G9 TCR 与 HLA-DQ2 结合特异性的关键决定因素,以及这种结合模式对 T 细胞激活的影响。然而,关于这种非典型识别模式的驱动因素以及 G9 TCR 在胸腺选择中的作用仍有待进一步研究。总体而言,该研究重塑了对 αβTCR 结合模式的认知,为深入理解 T 细胞免疫机制提供了重要依据,也为相关自身免疫疾病的研究和治疗开辟了新的方向。