基于纸基环介导等温扩增技术的高致病性禽流感H5亚型快速检测方法的开发与评价

【字体: 时间:2025年04月10日 来源:Scientific Reports 3.8

编辑推荐:

  本期推荐:针对高致病性禽流感病毒(HPAIV)现场检测需求,普渡大学团队开发了一种新型纸基RT-LAMP检测技术。该研究通过优化靶向H5-HA基因的引物组,实现了500拷贝/反应的检测限,在模拟临床样本中达到100%分析灵敏度与特异性。这种仅需水浴孵育、肉眼判读的低成本检测方案,为资源有限地区提供了高效的H5亚型AIV现场筛查工具,对禽流感疫情防控具有重要意义。

  

禽流感病毒(Avian Influenza Virus, AIV)尤其是H5N1等高致病性亚型(Highly Pathogenic Avian Influenza, HPAI)的频繁暴发,已成为全球公共卫生和农业经济的重大威胁。近年来更出现令人担忧的新趋势:2022年美国禽流感疫情导致4000万只家禽死亡,造成25-30亿美元经济损失;2024年春季H5N1病毒首次在奶牛中暴发跨物种传播。传统检测方法如RT-PCR虽灵敏度高,但依赖精密仪器和专业操作,难以在资源匮乏地区开展。开发快速、准确且成本低廉的现场检测技术,成为阻断病毒传播链条的关键突破口。

普渡大学Mohamed Kamel团队在《Scientific Reports》发表的研究,创新性地将环介导等温扩增技术(Loop-mediated Isothermal Amplification, LAMP)与纸基微流控平台(μPADs)相结合。研究人员以2022年美国火鸡分离株A/turkey/Indiana/22-003707-003/2022的HA基因为靶标,通过Primer Explorer v5软件设计12组引物,采用荧光定量与比色法双重验证体系,最终开发出可在65℃水浴中完成检测的纸基诊断工具。研究特别选用健康家禽的口咽拭子构建模拟临床样本,验证了该方法在复杂基质中的可靠性。

关键技术方法包括:1)针对H5-HA保守区设计12组LAMP引物,通过荧光信号强度和假阳性率评分系统筛选最优引物组;2)建立包含MgSO4、酚红指示剂的冻干纸基反应体系;3)使用Sous Vide恒温水浴装置实现稳定温控;4)采用WHO标准qPCR和自制qPCR双体系验证检测效能;5)测试10种牛源性和6种禽源性病原体的交叉反应性。

LAMP引物筛选部分,研究团队建立了包含反应时间、荧光强度、标准差等参数的加权评分系统。HPAIV.HA.5引物组以96分最高分胜出,其平均荧光强度达86,989.87 RFU,7分钟即可检出,且在所有阴性对照中均无假阳性。值得注意的是,HA.11和HA.12引物组因产生明显假阳性被淘汰,凸显了引物筛选的重要性。

检测限实验显示,在荧光LAMP体系中,最优引物组对体外转录RNA(IVT RNA)的检测下限达500拷贝/反应(25拷贝/μL),较传统RT-PCR灵敏度提高2-20倍。比色法验证中,阳性反应可通过酚红染料从粉红变黄的显色变化肉眼判读,与荧光结果高度一致。这种双重判读机制极大提升了方法的现场适用性。

特异性验证环节,研究人员构建了包含牛冠状病毒(BCV)、牛疱疹病毒1型(BHV-1)等16种常见动物病原体的交叉反应测试面板。HPAIV.HA.5引物组在所有非靶标病原体检测中均保持阴性,证实其针对H5-HA基因的高度特异性。这种严格的验证为后续临床应用奠定了可靠性基础。

纸基检测平台的性能评估是该研究最大亮点。将冻干试剂预载于5×5 mm色谱纸反应区,样本复溶后置于65℃水浴60分钟即可完成检测。在模拟临床样本测试中,该方法对加标1000拷贝/反应(2倍检测限)的30份口咽拭子实现100%检出率,与qPCR结果完全一致。这种"样本进-结果出"的设计,有效规避了传统方法中繁琐的核酸提取步骤。

讨论部分指出,相比需要热循环仪的RT-qPCR(检测限10拷贝/反应),该纸基LAMP虽灵敏度稍逊,但其操作简便性和成本优势(仅需水浴装置)使其更适合田间监测。研究者特别强调,该方法可适配智能手机拍照分析,未来通过集成加热模块有望实现完全自主化检测。目前局限主要在于:1)LAMP技术固有的气溶胶污染风险需通过改进密封工艺解决;2)个体色觉差异可能影响结果判读,需开发标准化比色卡。

该研究的创新价值体现在三方面:首先,这是首个针对H5亚型AIV的纸基LAMP检测方案,将实验室级分子检测转化为现场适用技术;其次,建立的引物评分系统为其他病原体检测引物设计提供范式;最后,冻干纸基平台可通过调整引物组合实现多重检测,为应对未来新发传染病提供技术储备。正如作者所述,这项技术有望成为"防控禽流感传播的第一道防线",特别是在缺乏实验室基础设施的发展中国家禽类养殖场。随着H5N1病毒跨物种传播能力不断增强,这种便携式检测工具的推广应用,将对人类和动物健康的"同一健康"防线构建产生深远影响。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号