新发现！中国云南老黄龙洞淡水细菌Roseateles cavernae sp. nov. 的探索及其意义

来自中国西南部云南省的研究人员从昆明老黄龙洞淡水样本中分离细菌。研究发现菌株 YIM B04394T为革兰氏阴性杆菌，经多方面分析确定是Roseateles新物种。该发现丰富了对洞穴微生物的认知。

　　从中国西南部云南省昆明老黄龙洞采集的淡水样本中，分离出了一种新细菌，被命名为 YIM B04394^T 。该菌株的细胞呈革兰氏阴性（Gram negative）、杆状（rod shaped）。它是需氧菌（aerobic），氧化酶阳性（oxidase positive），过氧化氢酶弱阳性（weakly catalase positive），能在 10 - 40℃（最适 28℃ ）、pH 6.0 - 8.0（最适 pH 7.0 ）以及低 NaCl 浓度（最高 5.0%）环境下生长。基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析显示，菌株 YIM B04394^T与Roseateles属的物种聚为一类。菌株 YIM B04394^T与相关物种R. toxinivorans DSM 16998^T和R. saccharophilus DSM 25082^T的 DNA - DNA 相关性值为 21.50 - 22.9% ，平均核苷酸同一性（ANI）相关性值为 76.47 - 76.93% 。主要脂肪酸包括 C_16:1ω6c和 / 或 C_16:1ω7c以及 C_16:0 。检测到呼吸醌为泛醌 - 8（Ubiquinone - 8），主要极性脂质为双磷脂酰甘油（diphosphatidylglycerol）、磷脂酰乙醇胺（phosphatidylethanolamine）和一种未知磷脂。其 DNA 的 G + C 含量为 67.89% 。综合系统发育基因组学和系统发育分析，结合表型和化学分类特征，该菌株代表了Roseateles属的一个新物种，命名为Roseateles cavernae sp. nov. 。模式菌株为 YIM B04394^T（= NBRC 115775^T = KCTC 92438^T = CCTCC AB2021502^T）。