栽培红花染色体水平基因组揭示驯化驱动的遗传多样性：脂肪酸合成、开花时间与黄酮代谢的分子机制

为解析作物驯化如何塑造遗传多样性，研究人员对云南(Yunhong-7)和安徽(Anhui-1)两地栽培红花进行染色体尺度基因组组装，结合PacBio和Hi-C技术，发现结构变异(SVs)导致FAD2基因拷贝数差异(39 vs 20)、UGT家族(197个成员)功能分化，并鉴定出调控早花表型的关键通路。该研究为作物适应性育种提供靶点。

　　在农业驯化的神奇剪刀下，红花(Carthamus tinctorius)演化出令人惊叹的遗传画卷。科学家们首次采用PacBio长读长测序与Hi-C三维基因组技术，破解了云南特色品种"云红7号"(Yunhong-7)的染色体级别基因组密码，并与安徽品种"皖红1号"(Anhui-1)展开跨地域基因组对决。

这场基因组的"大家来找茬"游戏揭示了精彩发现：脂肪酸合成赛道中，脂肪酸脱氢酶2(FAD2)基因家族上演了"复制战争"——云红7号携带39个FAD2基因副本，而皖红1号仅有20个，这种拷贝数变异(CNV)可能影响亚油酸合成效率。更令人称奇的是，结构变异(SVs)如同基因组乐高积木的重新拼装，改写了生物钟相关基因的调控程序，使得云南选手比安徽选手提前"打卡开花"。

研究人员还从197个UDP-葡萄糖醛酸转移酶(UGT)基因中锁定两位"特工"——CtUGT.18和CtUGT.191，通过原核表达系统揭秘了它们在黄酮类化合物糖基化中的催化绝活。这项研究如同给作物驯化史装上基因显微镜，为培育高产早熟、营养强化的新型红花品种绘制了分子蓝图。