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前列腺癌(PCa)治疗面临耐药难题,为探寻新疗法,研究人员开展关于长链非编码 RNA(lncRNA)PRCAT71 的研究。结果发现 PRCAT71 可促进 AR 信号传导,其与 KHSRP、AR 形成的调控轴或成治疗靶点,为 PCa 治疗提供新思路。
前列腺癌,这个在男性群体中肆虐的 “健康杀手”,是美国男性中最常见的非皮肤癌,也是癌症相关死亡的第二大原因,全球每八名男性中就可能有一人在一生中被诊断出患有前列腺癌。目前,雄激素剥夺疗法是晚期前列腺癌的主要治疗方法,但多数患者在不到两年的时间里就会发展为去势抵抗性前列腺癌(CRPC)。现有的第二代 AR 拮抗剂虽能带来一定生存益处,却无法阻止患者最终出现耐药并走向死亡。这一困境促使科研人员不断探索,试图寻找新的治疗靶点和策略。
在此背景下,某研究机构的研究人员开展了一项针对长链非编码 RNA(lncRNA)的研究,旨在揭示其在前列腺癌发生发展中的作用机制,寻找潜在的治疗靶点。研究成果发表在《SCIENCE ADVANCES》杂志上。
为开展此项研究,研究人员主要运用了以下关键技术方法:通过对来自癌症基因组图谱(TCGA)等数据库的 RNA 测序(RNA-seq)数据进行分析,筛选差异表达的 lncRNA;采用定量逆转录 PCR(qRT-PCR)、蛋白质免疫印迹(Western blot)、染色质免疫沉淀(ChIP)等实验技术,检测基因和蛋白的表达水平、蛋白与 DNA 的结合情况;运用 RNA 免疫沉淀(RIP)及 RIP 测序(RIP-seq)技术,探究 RNA 与蛋白的相互作用;还构建了小鼠异种移植模型,进行体内实验研究肿瘤生长情况 。
研究结果如下:
- PRCAT71 是 PCa 特异性 lncRNA:分析 TCGA 研究中正常前列腺和局限性 PCa 组织的 RNA-seq 数据,发现 PRCAT71 在 PCa 组织中高表达。对多种组织和细胞系检测显示,其在前列腺组织和 AR 阳性细胞中高表达,且主要位于细胞核。敲低 PRCAT71 可抑制 PCa 细胞生长、诱导细胞周期阻滞和凋亡,抑制集落形成和细胞迁移。
- 沉默 PRCAT71 抑制 AR 信号:对 LNCaP 细胞进行 RNA-seq 分析,发现敲低 PRCAT71 会抑制 AR 信号通路相关基因。基因集富集分析(GSEA)显示,敲低 PRCAT71 显著抑制 AR 上调基因、增加 AR 下调基因。过表达或敲低 PRCAT71 会相应改变 AR 及其靶基因的转录和蛋白水平,且敲低 PRCAT71 会减少 AR 与靶基因增强子的结合,表明 PRCAT71 可上调 AR 表达并激活 AR 信号。
- PRCAT71 结合并稳定 AR mRNA:通过生物信息学预测及体外实验证实,PRCAT71 可与 AR mRNA 的 3′非翻译区(3′UTR)相互作用。RNA 保护实验表明,二者形成的 RNA 双链可保护相互作用区域免受核糖核酸酶(RNase)降解。敲低 PRCAT71 会降低 AR mRNA 稳定性,而过表达无 3′UTR 的 AR 可挽救因敲低 PRCAT71 导致的 AR 和 PSA 表达下降,说明 PRCAT71 通过直接结合 AR mRNA 的 3′UTR 来稳定 AR mRNA。
- PRCAT71 促进 KHSRP 与 AR mRNA 的相互作用:预测并验证 KHSRP 是 PRCAT71 的结合蛋白,二者相互作用区域分别位于 PRCAT71 的 5′端(1 - 243 核苷酸)和 AR mRNA 3′UTR(491 - 735 核苷酸)。敲低 PRCAT71 会抑制 KHSRP 与 AR mRNA 的相互作用,而添加 PRCAT71 可增强这种相互作用,表明 PRCAT71 能促进 KHSRP 与 AR mRNA 的结合。
- KHSRP 稳定 AR mRNA 并促进 PCa 进展:敲低 KHSRP 可抑制 PCa 细胞生长、集落形成和迁移,抑制体内肿瘤生长。RNA-seq 和 GSEA 分析显示,敲低 KHSRP 会抑制 AR 信号通路及相关基因表达,降低 AR mRNA 稳定性。免疫荧光和免疫组化染色表明 KHSRP 主要在细胞核发挥作用,敲低 KHSRP 会增加 XRN2 与 AR mRNA 的结合,说明 KHSRP 和 PRCAT71 通过阻止 XRN2 结合来稳定 AR mRNA,促进 AR 信号传导。此外,KHSRP 表达与 PCa 进展相关,可作为 PCa 诊断和预后的生物标志物。
- AR 激活 PRCAT71 的转录:分析发现 AR 和 H3K27ac 在 PRCAT71 上游有显著结合区域,AR 抑制或激活会相应降低或增加 PRCAT71 表达。在 VCaP 小鼠异种移植模型中,去势后 PRCAT71 表达先下降后回升,与 AR 信号变化一致。此外,GATA2 作为 AR 的辅助因子也参与调控 PRCAT71 表达,二者形成正调控环路。
- 抑制 PRCAT71 抑制 CRPC 进展:体外实验和小鼠异种移植模型表明,敲低 PRCAT71 可抑制 CRPC 细胞生长和肿瘤进展。临床数据分析显示,PRCAT71 在 PCa 组织中高表达,与肿瘤分级、AR 活性相关,高表达 PRCAT71 的患者无转移生存期更差,说明 PRCAT71 可作为 PCa 诊断和预后的生物标志物,也是 CRPC 治疗的潜在靶点。
综上所述,该研究发现 lncRNA PRCAT71 通过增强 KHSRP 与 AR mRNA 的相互作用来稳定 AR mRNA,进而激活 AR 信号传导,促进前列腺癌进展。PRCAT71 和 KHSRP 在 CRPC 中发挥重要作用,有望成为前列腺癌诊断、预后评估的生物标志物以及治疗的新靶点,为前列腺癌的治疗开辟了新的方向,为攻克这一疾病带来了新的希望。