热带环境下圣伊内斯羊多产性的全基因组关联研究：探寻关键基因，助力绵羊繁育

为确定热带条件下圣伊内斯羊多产性相关的基因组区域，研究人员对 715 只母羊 2000 - 2018 年的 1584 条产羔记录进行分析。利用单步全基因组关联研究（ssGWAS），确定了 21 个相关 SNP 窗口，发现多个相关基因。该研究有助于多产性基因组研究及选种。

　　本研究旨在识别热带环境下饲养的圣伊内斯羊（Santa Inês sheep）多产性相关的基因组区域。母羊的多产性被定义为单胎（每只母羊每次产羔仅产一只羔羊）或多胎（每只母羊每次产羔产多只羔羊）。对表型数据进行质量控制后，使用了 2000 年至 2018 年间 715 只雌性的 1584 条产羔记录。利用绵羊 50K 单核苷酸多态性芯片（OvineSNP50 BeadChip panel，Illumina 公司）对动物进行基因分型。对基因组数据进行质量控制后，46714 个单核苷酸多态性（SNP）和 388 个样本及雌性的信息用于后续分析。采用单步全基因组关联研究（ssGWAS）方法来估计遗传标记的效应及其与多产性的关联。共鉴定出 21 个由 10 个相邻 SNP 组成的窗口，这些窗口至少解释了多产性加性遗传方差的 0.5%。在这些区域中，发现了与雌性不同生殖功能相关的基因：CACNA₁E、NTRK1、PLCH1、SMAD3、CENPF、TOPBP1、IL33、DRD2、MID1、HCCS 和 ARHGAP6。一些与多产性相关的候选区域包含此前未被描述的基因以及功能未知的基因。这些结果有助于识别与多产性相关的基因，可用于多产性的基因组生殖研究，以及在群体中选择多产性最高的母羊。