通过整合基因表达数据分析揭示精神分裂症氧化应激相关分子特征及潜在治疗靶点的研究意义
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时间:2025年04月12日
来源:Molecular Neurobiology 4.6
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为探究精神分裂症氧化应激相关基因表达机制,解决其诊断缺乏敏感特异性生物标志物和预测模型的问题,研究人员分析 GSE38484 和 GSE54913 的全基因组 mRNA 表达谱,识别出 5 个氧化应激相关的枢纽基因并构建诊断模型,有助于深入理解疾病机制和诊疗。
精神分裂症是一种严重的精神障碍,其特征为氧化应激失衡。精神分裂症中氧化应激相关基因表达的潜在机制有待进一步研究。此外,精神分裂症的诊断缺乏敏感且特异的生物标志物,以及评估易感性的预测模型。研究人员利用加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis)和机器学习方法,对 GSE38484(精神分裂症患者 106 例,对照组 96 例)和 GSE54913(精神分裂症患者 18 例,对照组 12 例)的全基因组 mRNA 表达谱进行分析,以识别精神分裂症中与氧化应激相关的枢纽基因。随后进行了基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis)、蛋白质 - 蛋白质相互作用网络分析、免疫细胞浸润分析和分子对接。还构建了诊断模型。研究人员确定了精神分裂症中与氧化应激相关的 5 个枢纽基因:组织蛋白酶 B(CTSB)、核糖核酸酶抑制因子 1(RNH1)、减数分裂重组蛋白 8(REC8)、富组氨酸糖蛋白 4(ITIH4)和肿瘤坏死因子 α 诱导蛋白 8 样蛋白 1(TNFAIP8L1),并构建了诊断模型(AUC = 0.954)。5 个枢纽基因和 20 个共表达基因在与内肽酶和核糖核酸内切酶活性相关的通路中富集。在精神分裂症样本中,7 种免疫细胞类型的丰度存在显著差异。药物预测和分子对接表明,尿素(UREA)和香豆素(COUMARIN)是潜在的针对 CTSB 的治疗药物。研究人员确定了精神分裂症中与氧化应激相关的 5 个枢纽基因:CTSB、RNH1、REC8、ITIH4 和 TNFAIP8L1。还进行了下游分析并构建了精神分裂症的诊断模型。
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