抗菌化合物靶向非增殖期和胞内细菌:药物重筛揭示29种新型抗持久感染候选物

【字体: 时间:2025年04月12日 来源:npj Antimicrobials and Resistance

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  编辑推荐:针对慢性感染中耐受抗生素的非增殖细菌这一临床难题,研究者通过高通量筛选6454种已批准药物,鉴定出39种能有效杀灭或抑制尿路致病性大肠杆菌(UPEC)静止期细胞的化合物,其中29种为首次报道。关键发现包括10种化合物对铜绿假单胞菌(P. aeruginosa)展现>4 log10杀灭效果,且31种可抑制人肠上皮细胞内痢疾杆菌(S. flexneri)生长,为开发抗持久感染疗法提供新思路。

  

慢性细菌感染如同医学界的"幽灵刺客",它们通过进入休眠状态或躲藏进人体细胞,巧妙逃逸常规抗生素的追杀。这种狡猾的生存策略导致尿路感染(UTI)等疾病反复发作,成为临床治疗的顽固堡垒。更令人担忧的是,这些"装死"的细菌在逃避杀灭的同时,还悄悄积累基因突变,为全面耐药埋下祸根。传统抗生素研发都聚焦于生长旺盛的细菌,使得针对非增殖细菌(non-growing bacteria)的特效药物长期缺位。

面对这一挑战,来自爱沙尼亚塔尔图大学等机构的研究团队另辟蹊径,将目光投向已获批药物的再利用。研究者建立创新的稀释再生法(dilution-regrowth assay),对6454种临床阶段化合物展开系统筛选,相关成果发表在《npj Antimicrobials and Resistance》。这项研究不仅发现多种"老药"具有抗持久感染新用途,更揭示了药物活性与细菌代谢状态的微妙关系,为破解慢性感染治疗困境提供了全新武器库。

研究采用三大关键技术:1)模拟胞内环境的酸性低磷酸盐培养基(LPM)培养系统;2)基于光学密度监测的自动化高通量筛选平台;3)新型sfGFP标记的痢疾杆菌胞内感染模型。通过整合这些方法,团队实现了从体外杀菌到胞内药效的多维度评估。

在"稀释再生筛选鉴定延缓非增殖UPEC再生的化合物"部分,研究显示在pH 7.4条件下筛选出54个活性化合物,酸性pH 5.5环境下获得38个,其中23个具有双环境活性。验证实验确认39个化合物能显著延迟细菌再生,包括19种氟喹诺酮类(fluoroquinolones)和5种大环内酯类(macrolides)。值得注意的是,杀菌后效应(PAE)与直接杀灭作用共同贡献了再生延迟现象,这在sitafloxacin等药物中表现尤为突出。

关于"pH和培养基组成对活性的影响",研究发现多数化合物在酸性LPM中活性降低,但抗癌药mitomycin C(MMC)和rifamycins却呈现pH依赖性增效。与Collins实验室报道不同,抗炎药semapimod在本研究条件下无活性,提示培养基成分对结果具有决定性影响。

"化合物对不同病原体的活性谱"揭示惊人发现:solithromycin对生长态铜绿假单胞菌的MIC高达80μM,却能杀灭4 log10静止期细菌。10种化合物在2.5μM浓度下对铜绿假单胞菌展现超强杀灭效果,而金黄色葡萄球菌(S. aureus)仅对MMC等少数药物敏感。这种物种特异性差异为精准抗感染提供了重要线索。

在"亚MIC浓度下的广谱活性"方面,数据表明valnemulin等药物在远低于MIC浓度下即可抑制非增殖细菌,且这种活性与细菌生长速率呈负相关。特别值得注意的是,efflux pump抑制剂PaβN不能逆转高MIC现象,提示存在其他调控机制。

通过"胞内痢疾杆菌生长抑制评估",31种化合物展现出穿透真核细胞膜的能力,其中rifabutin的胞内活性比胞外高10倍。而DNA损伤实验显示,抗癌药evofosfamide(EVO)等能诱导SOS反应,但仅在对数生长期有效,静止期细菌表现出独特的损伤应答模式。

这项研究开创性地建立了抗持久感染药物的系统筛选体系,其核心价值在于:首次证实临床可用药物中存在针对非增殖细菌的特异性杀伤剂;揭示药物活性的pH依赖性和物种特异性规律;开发出可模拟胞内环境的药效评估平台。特别具有临床转化潜力的是solithromycin等"高MIC-强静止期活性"药物,它们可通过与常规抗生素联用,实现对活跃与休眠细菌的"双杀"效果。

研究者也客观指出局限性:PAE现象可能干扰杀菌效果评估;临床菌株验证尚未开展;抗癌药的基因毒性可能限制其应用。这些发现不仅为抗持久感染药物开发指明方向,更启示学术界应重新审视抗生素疗效评价体系——或许我们需要建立独立于MIC的"抗静止期活性"评价标准,才能真正攻克慢性感染治疗这一世纪难题。

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