基于mNGS的肺结核患者肺微生物组特征与MTBC丰度临床价值研究

编辑推荐：为解决肺结核(PTB)诊断难题及探索疾病严重度与微生物组关联，浙江中西医结合医院团队通过mNGS技术分析190例患者BALF样本，首次系统揭示MTBC丰度与肺微生物组α/β多样性、影像学特征及住院时长显著相关，为PTB精准诊疗提供新视角。研究发表于《Scientific Reports》。

　　 肺结核(PTB)作为全球十大死因之一的传染病，每年导致约160万人死亡。尽管现有诊断技术如GeneXpert和T-SPOT.TB已广泛应用，但传统培养耗时长、涂片法灵敏度低，且无法反映MTBC（结核分枝杆菌复合群）感染与宿主微生物组的互作关系。更棘手的是，肺微生物组在PTB发病中的作用机制尚不明确，临床亟需能同时实现病原检测和疾病分层的新方法。

浙江中西医结合医院联合北京微领医学团队开展了一项回顾性研究，首次将mNGS（宏基因组下一代测序）技术与临床指标结合，系统分析了190例PTB患者BALF（支气管肺泡灌洗液）中MTBC丰度与肺微生物组特征的关系。研究发现高MTBC丰度组患者双侧肺叶受累比例达69.23%，空洞发生率显著升高（44.23% vs 7.89%），且住院时间延长至9.38±4.96天。该成果发表于《Scientific Reports》，为PTB的精准诊疗提供了微生物组学层面的新依据。

研究采用三大关键技术：1）基于Illumina NextSeq 550Dx平台的mNGS检测，以RPTM（每千万 reads数）量化MTBC丰度；2）多模态诊断比对（包括GeneXpert、T-SPOT.TB和培养法）；3）微生物组分析（α/β多样性计算和LEfSe差异物种筛选）。样本来自2022-2023年就诊的PTB患者队列，排除合并其他肺部感染者。

主要结果：

1. 患者特征：高丰度组吸烟饮酒史更显著（28.85% vs 9.21%），咳嗽症状比例达61.54%，且GR%（粒细胞比例）与PLT（血小板）呈上升趋势，LY%（淋巴细胞比例）和HBG（血红蛋白）下降。
2. 诊断效能：mNGS阳性率100%，显著高于GeneXpert（71.58%）和培养法（68.95%），且高丰度组培养阳性率高达98.08%。
3. 微生物组特征：α多样性随MTBC丰度升高而降低（P=3.9×10^-8），高丰度组MTBC占比83.58%，伴随Tropheryma whipplei和Candida albicans富集；LEfSe分析揭示Treponema lecithinolyticum为高丰度组标志菌。
4. 临床关联：MTBC丰度与住院时长正相关（r=0.32, P=0.0054），提示其可作为预后评估指标。

结论与意义： 该研究首次建立MTBC丰度与肺微生物组失衡的直接关联，证实高负荷感染会重塑微生物群落并加剧炎症反应。临床层面，mNGS联合影像学特征（如空洞病变）能有效识别重症PTB患者，而微生物组动态监测有望指导个体化治疗。局限性在于缺乏健康对照和治疗后随访数据，未来需扩大样本验证。这项研究为理解PTB发病机制开辟了新视角，推动感染性疾病诊疗进入"病原-菌群-宿主"三位一体新时代。