《BMC Genomics》:Growth resilience to weather variation in commercial free-ranging chickens in Ethiopia
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在撒哈拉以南非洲家禽业快速发展但面临诸多挑战的背景下,研究人员开展 “Growth resilience to weather variation in commercial free-ranging chickens in Ethiopia” 的研究。他们发现鸡对天气变化的生长适应力表型存在显著基因组变异,这为商业鸡的基因组选择提供依据,有助于提升鸡在不同天气下的生产水平。
在撒哈拉以南非洲,家禽业正蓬勃发展,小农户养殖模式占据主导地位。随着经济和人口的增长,对家禽产品的需求与日俱增,这促使大量高产品种的引进和杂交。然而,这些携带外来基因的商业鸡在小农户的管理下,难以适应本地气候。气候变化带来的气温波动、降水变化等,更是让鸡的生长和生产面临严峻挑战。为了解决这些问题,来自苏格兰农村学院(SRUC)、国际家畜研究所(ILRI)等机构的研究人员,开展了一项关于埃塞俄比亚商业散养鸡对天气变化生长适应力的研究。该研究成果发表在《BMC Genomics》上。
研究人员主要运用了随机回归方法和基因型测序技术。他们收集了 1590 只 T451A Sasso 鸡的个体数据,这些鸡在模拟小农户散养条件下生长。同时,获取了 2019 - 2021 年的天气数据,包括气温、湿度、降水量等,并计算出温度 - 湿度指数(THI)。
在研究结果部分:
- 天气数据探索:研究期间,埃塞俄比亚亚的斯亚贝巴的气温在 4 - 33°C 之间波动,不同季节的温湿度和降水量差异明显。Bega 季节气温较低、湿度较小;Belg 季节最高气温较高、湿度较低;Kiremt 季节则是高湿度和大量降水。
- 群体反应规范:通过回归模型分析发现,大多数天气变量的线性和二次系数显著不为零,表明这些天气变量对鸡的生长有显著影响。其中,最高气温、平均降水量和平均相对湿度对鸡生长的影响最为显著。
- 个体偏差反应规范:个体偏差规范系数的方差显示,个体鸡对平均相对湿度和平均气温的反应差异较大,而对天气事件周方差的反应较为相似。同时,通过相关性分析发现,快速生长的鸡在不同天气条件下的生长表现存在差异,且与慢速生长的鸡对天气变化的耐受性不同。
- 适应力表型:研究开发了鸡对不同天气变量的生长适应力表型,其中与平均每日温度和 THI 周均值变化相关的适应力表型变异性最高。
- 基因组分析:对生长适应力表型的基因组分析表明,部分与平均气温、最低气温和 THI 变化相关的生长适应力表型存在显著的基因组方差和中等偏低的遗传力(0.11 - 0.21)。全基因组关联研究发现了 5 个与生长适应力表型相关的单核苷酸多态性(SNP)标记,这些标记与脂质代谢、脂肪细胞稳态等相关基因有关。
研究结论和讨论部分指出,随机回归模型可用于推导鸡生长适应力表型,该研究发现的显著基因组变异和候选基因,为应对气候变化、可持续提高鸡的生产提供了重要信息。尽管研究揭示了鸡对天气变化适应力的部分遗传基础,但仍需进一步研究天气波动影响鸡生长的生物学机制,以及其他环境因素对鸡热适应力的影响。这不仅有助于完善预测模型,还能为后续研究和家禽养殖的发展提供方向,对推动家禽业在不断变化的环境中持续发展具有重要意义。