CRISP:基于因果关系的深度学习框架,精准预测 ICU 患者死亡率的新希望

《BMC Medical Informatics and Decision Making》:CRISP: A causal relationships-guided deep learning framework for advanced ICU mortality prediction

【字体: 时间:2025年04月16日 来源:BMC Medical Informatics and Decision Making 3.3

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  在临床护理中,ICU 患者死亡率预测至关重要。研究人员开展 “CRISP:一种因果关系引导的深度学习框架用于高级 ICU 死亡率预测” 的研究。结果显示 CRISP 模型在不同数据集上表现稳定,可提升 DL 在临床决策支持中的应用。

  在医院的重症监护病房(ICU)里,住着许多病情危重的患者,对他们死亡率的精准预测就像一场与死神的赛跑,直接关乎治疗决策的制定和患者的生死。传统的评分系统,如急性生理学与慢性健康评估(APACHE)II 和 III、简化急性生理学评分(SAPS)II 和 III 、序贯器官衰竭评估(SOFA)等,虽然在一定程度上能预测死亡率,但存在不少问题。随着时间推移,这些工具的预测准确性会下降,因为人们的预期寿命增加、公共卫生状况改变以及新疾病不断出现。而且,部分现有评分系统比较静态,大多依赖 ICU 入院第一天收集的数据,这就迫使临床医生不得不依靠主观判断,容易产生偏差。另外,在不同国家进行验证时,这些评分系统的表现也不一致,说明对不同患者群体的考虑不够充分。
为了解决这些难题,四川大学的研究人员开展了一项关于 “CRISP:一种因果关系引导的深度学习框架用于高级 ICU 死亡率预测” 的研究 。他们提出了 CRISP(Causal Relationship Informed Superior Prediction)模型,将因果关系融入到数据增强和预测模型中。该研究成果发表在《BMC Medical Informatics and Decision Making》上。

研究人员主要采用了以下关键技术方法:首先,利用因果发现算法中的图形自动编码器(GAE)识别一般因果结构,构建因果有向无环图(DAG)来表示变量间的因果关系。其次,设计了反事实少数生成模块(CMG),通过基于因果图和倾向得分匹配的方法来生成少数类样本,解决数据不平衡问题。最后,CRISP 模型采用基于 Transformer 的架构,结合因果结构处理特征组和基本患者信息进行死亡率预测,并将平均治疗效果(ATE)融入损失函数优化模型。研究使用了来自麻省理工学院实验室维护的 MIMIC-III、MIMIC-IV 公开数据库,以及四川大学华西医院(WCHSU)的数据集。

下面来看具体的研究结果:

  • 数据采样性能:研究对比了多种数据采样方法,使用 AUPRC(精度召回曲线下面积)和 MCC(马修斯相关系数)评估模型在类平衡方面的表现。在 MIMIC-III 数据集上,所有基于 CMG 处理数据训练的模型都优于基线模型,其中 CRISP 结合 CMG 的模型表现最佳。在 MIMIC-IV 数据集上,CMG 的得分超过基线,CRISP 和 CMG 的结果更稳定。在 WCHSU 数据集上,由于数据不平衡严重,多数模型表现不佳,但 CMG 在 MCC 指标上优于其他方法。
  • 优于传统模型:将 CRISP 模型与传统机器学习算法对比,在三个数据集上,CRISP 模型都取得了有竞争力的结果。例如在 MIMIC-IIItest评估集中,CRISP 模型的 AUROC(受试者工作特征曲线下面积)达到 0.9480,AUPRC 为 0.7611,MCC 为 0.6678 ,超过了 XGBoost 等传统模型。
  • 优于深度学习模型:与近期使用 MIMIC-III 数据集的深度学习模型相比,CRISP 和 MMDL 在各项指标上表现突出,CRISP 的 AUROC 略高于其他模型。消融研究表明,结合因果推断的模型性能更好,虽然提升幅度较小,但证明了整合因果关系和多种数据类型的优势。
  • 在其他临床结局场景的表现:研究人员以急性肾损伤(AKI)为例,在 MIMIC III 数据集上验证 CRISP 模型预测 AKI 的能力。结果显示,CRISP 模型在预测 AKI 时,AUROC 在 0.7557 - 0.7899 之间,AUPRC 在 0.4061 - 0.7877 之间,且在处理类不平衡问题时表现更稳定。

在结论和讨论部分,研究表明 CRISP 模型将因果关系集成到数据增强和预测模型中,展现出良好的性能。CMG 模块利用因果图生成新的少数类实例,其预测性能与传统过采样技术相当。CRISP 模型结合因果图处理特征组和患者基本信息,在死亡率预测方面表现出色,在不同数据分布下都具有较好的泛化能力。这一研究成果凸显了基于因果关系的方法在实际临床应用中的潜力,为临床决策支持提供了更可靠的工具,有助于提高医疗质量,改善患者的治疗效果。不过,该研究也存在一些局限性,如深度学习方法在标准化临床预测指标方面存在挑战,未来还需进一步探索 ICU 住院期间时间数据之间的因果关系,结合临床医生反馈优化模型等。但总体而言,这项研究为 ICU 患者死亡率预测开辟了新的道路,具有重要的临床意义和研究价值。
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