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Isthmin-1(ISM1)的晶体结构解析及其在前脂肪细胞信号传导中功能角色的重新评估
《Nature Communications》:
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年04月16日 来源:Nature Communications
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编辑推荐:本研究通过解析含AMOP结构域的ISM1晶体结构,首次揭示该结构域具有类似链霉亲和素的β-桶状核心,并发现既往报道的ISM1诱导3T3-F442A前脂肪细胞AKT磷酸化活性实为Expi293表达系统共纯化的PDGFA/GDF15所致,为代谢疾病研究提供了关键结构依据并纠正了功能认知误区。
为揭开这些谜团,美国耶鲁大学医学院Daryl E. Klein团队联合多学科力量,在《Nature Communications》发表了突破性研究成果。研究者们采用X射线晶体学首次解析了ISM1的三维结构,分辨率达到3.5?,成功捕获了包含血栓反应蛋白I型重复序列(TSR)和AMOP结构域的关键区域。令人惊讶的是,AMOP结构域展现出独特的"手持筷子"拓扑结构:中央5条反平行β链构成类似链霉亲和素的β-桶状核心(Dali Z-score=3.3),N端和C端螺旋像筷子般分列两侧,而中间的螺旋区域则发挥"拇指"的稳定作用。这种新颖结构为理解AMOP家族蛋白的功能多样性提供了框架——虽然核心β桶在进化中保守,但表面螺旋和环区的高度可变性可能造就了不同的相互作用表位。
研究团队特别关注了曾被报道介导整合素结合的"RKD"序列。结构分析显示该序列位于AMOP结构域第二β链上,而非典型RGD整合素结合环区域。通过AlphaFold3建模发现,ISM1与整合素αVβ5或α8β1的相互作用根本不涉及RKD序列,而是通过整合素α亚基β-螺旋桨的替代位点(ipTM>0.7)。这一发现颠覆了既往关于ISM1通过RKD-整合素相互作用调控血管生成的认知。
更引人深思的是功能验证实验。当研究团队用3T3-F442A前脂肪细胞系(既往报道响应ISM1刺激的模型)测试时,发现仅经金属螯合层析(IMAC)纯化的ISM1确实能诱导AKT-S473磷酸化,但通过分子筛(SEC)进一步纯化后活性显著降低。对照实验揭示关键真相:Expi293条件培养基(未转染ISM1)经相同纯化流程后仍具同等活性,质谱分析锁定25-30kDa区段的PDGFA和GDF15为"真凶"。这些生长因子在纳摩尔浓度即可激活AKT通路,而双Strep标签纯化的ISM1则完全无此活性。
该研究运用了多项关键技术:1)哺乳动物细胞表达系统结合硒代甲硫氨酸标记解决相位问题;2)X射线晶体学解析TL-AMOP片段结构;3)小角X射线散射(SAXS)分析溶液状态寡聚化;4)基于AlphaFold2/3的AMOP家族蛋白结构预测;5)磷酸化蛋白质印迹分析信号通路;6)质谱鉴定共纯化污染物。
研究结果部分:
"整体结构"显示ISM1的TSR和AMOP结构域通过柔性连接子相连,TSR中WSXW基序的C-甘露糖化修饰得到确认;"AMOP结构域比较"揭示ISMI/ISM2特有的C端螺旋在其他AMOP蛋白(如MUC4)中缺失;"寡聚化状态"通过SAXS证实生理浓度下AMOP结构域呈单体状态;"功能验证"章节通过系统对照实验证明PDGFA/GDF15才是3T3-F442A细胞AKT激活的真正效应分子。
这项研究具有双重里程碑意义:结构生物学层面首次揭示AMOP结构域独特的"β桶-螺旋"架构,为理解该蛋白家族功能多样性奠定基础;功能研究层面则纠正了领域内重要认知偏差,提示代谢研究需警惕表达系统污染物干扰。这些发现不仅重新定义了ISM1的分子特征,也为开发靶向AMOP结构域的干预策略提供了精确的"分子蓝图"。未来研究需要进一步阐明ISM1真实受体系统,并探索其核心β桶结构如何介导多种,我将继续为您服务。如果您有任何问题或需要帮助,请随时告诉我!
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