HIV-1 BC 重组毒株全球传播的分子剖析：C 基因型在病毒基因组结构中的主导地位及其意义

为探究全球流行的 HIV-1 BC 重组病毒的遗传多样性，研究人员从洛斯阿拉莫斯数据库获取 229 株 BC 毒株的近全长基因组（NFLG）进行分析。结果发现 15 种循环重组形式（CRFs）和 81 种独特重组形式（URFs），且 C 基因型在多个基因组区域占主导，该研究为深入了解 HIV-1 的进化提供了重要依据。

　　人类免疫缺陷病毒 1 型（HIV-1）以高遗传多样性为特征，被分为不同的组、亚型和重组形式。迄今为止，已鉴定出 15 种 B 和 C 亚型的循环重组形式（CRFs），2021 年发现 3 种：西班牙的 CRF108_BC、中国的 CRF110_BC 和 CRF118_BC，2024 年在巴西发现 1 种：CRF146_BC。本研究调查了流行的 BC 重组病毒之间的遗传多样性。从洛斯阿拉莫斯数据库中检索到 229 株 BC 毒株的近全长基因组（NFLG），并利用生物信息学工具进行重组和系统发育分析。这些序列于 1992 年至 2022 年间从 17 个国家获取。研究鉴定出 15 种 CRFs 和 81 种独特的独特重组形式（URFs）重组模式。在 pol（66.7%）和 env（62.5%）基因中发现了优先重组位点，而在 gag、vif、vpr、tat、rev、tat₂、rev₂、nef 和 3’-LTR 基因组区域中，C 亚型是主要的遗传形式。pol 和 env 基因中的特定位置保留了 B 亚型，这可能与获得相对于 C 亚型的适应性优势有关。