苹果栽培品种线粒体基因组高度保守性解析:阿克苏富士与国光苹果的比较基因组学研究
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时间:2025年04月17日
来源:Cytology and Genetics 0.5
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为解决苹果线粒体(mt)基因组研究不足的问题,研究人员采用Illumina测序技术对阿克苏富士和国尔斯珍妮特品种开展比较基因组分析。研究发现二者mt基因组结构完全一致(396592bp),含63个PCGs、20个tRNA和4个rRNA基因,检测到419-421个RNA编辑位点,证实栽培苹果mt基因组高度保守性,为苹果系统进化研究提供新依据。
苹果作为全球最具经济价值的水果之一,其线粒体(mt)基因组研究长期受限于结构复杂性。本研究通过Illumina测序技术,首次完成阿克苏富士和国尔斯珍妮特两个栽培品种mt基因组的精细组装(长度均为396592bp),揭示其包含63个蛋白质编码基因(PCGs)、20个转运RNA(tRNA)和4个核糖体RNA(rRNA)的标准化配置。有趣的是,在叶绿体基因组渗入分析中,发现国尔斯珍妮特含44个线粒体-质体片段(MTPTs),阿克苏富士含31个,分别占各自基因组的1.98%和2.19%。更引人注目的是,通过RNA编辑位点检测发现两个品种分别存在419和421个编辑位点,而密码子使用偏好性、核苷酸多样性及选择压力分析均表明栽培苹果mt基因组呈现惊人的保守性。系统发育树显示这两个栽培种与山荆子(Malus baccata)和甘肃海棠(M. kansuensis)聚为一支,为蔷薇科植物进化研究提供了新的分子证据。
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