人类腹部手术伤口分离的Dysgonomonas hofstadii DSM 104969T基因组测序及耐药机制解析

来自美国能源部联合基因组研究所的研究团队报道了从芬兰赫尔辛基大学中心医院患者手术伤口中分离的革兰阴性菌Dysgonomonas hofstadii DSM 104969T的基因组特征。通过Illumina NovaSeq平台完成5.03 Mbp基因组测序（GC含量39.27%），发现含AcrAB-TolC等外排泵系统和ardA/ardC抗限制基因，为揭示该临床分离株的多重耐药机制提供了重要线索。

　　科学家们揭开了一株特殊细菌的遗传密码——从72岁男性患者腹部手术伤口中分离的Dysgonomonas hofstadii DSM 104969^T。这株革兰阴性球杆菌在37℃含血红素的培养基中茁壮成长，其基因组测序数据通过美国能源部联合基因组研究所(KMG-IV计划)的Illumina NovaSeq 6000平台获得，采用SPAdes软件组装后获得44个支架(scaffold)，覆盖度高达296.8倍。

这5,035,418 bp的基因组藏着4,321个基因，包括能对抗宿主防御的抗限制基因(ardA/ardC)，以及AcrAB-TolC、Hae-1、NodT等多套外排泵系统——这些分子"排污泵"很可能是导致抗生素和重金属耐药的关键"帮凶"。通过TYGS服务器进行的全基因组系统发育分析显示，它与近亲D. capnocytophagoides的DNA-DNA杂交相似度仅为32.8%。

该基因组数据已存入GenBank(JACIEP000000000)，为医院感染防控提供了新的分子靶点，也让人们更深入理解临床病原菌如何通过"基因窃取"获得耐药超能力。研究获得加州州立大学"领养基因组计划"支持，DNA质量控制由德国微生物保藏中心(DSMZ)专家完成。