综述:成为 GEM:生物遏制、环境应用的基因工程微生物

【字体: 时间:2025年04月17日 来源:Advanced Drug Delivery Reviews 15.2

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  本文聚焦基因工程微生物(GEMs)。阐述其在医疗、农业、环保等多领域应用潜力,探讨生物遏制技术,分析其在环境适应性、监管、公众认知方面的情况,强调考虑非技术因素对 GEMs 发展的重要性,为相关研究和应用提供参考。

  

基因工程微生物:现状与挑战

在医疗科学和工程技术不断进步的当下,人们借助有效的疫苗、强力的抗生素、更及时准确的诊断方法以及多样的治疗手段,得以延长寿命。然而,全球人口的增长和经济发展的不均衡,引发了一系列严峻的全球性问题,如气候危机、污染、公共卫生难题、与衰老相关的疾病、粮食分配不均,以及能源、化学品和材料的可持续供应问题等。面对这些日益复杂的问题,创新方法的探索迫在眉睫,基因工程微生物(Genetically Engineered Microbes,GEMs)的应用成为其中备受瞩目的方向。

一、GEMs 的应用潜力

GEMs 在众多领域展现出巨大的应用潜力。在医疗领域,它可作为非侵入性的活体诊断工具,还能将活体治疗药物输送到靶器官和癌细胞。在农业方面,GEMs 能够高效地固定氮和碳,不仅有助于提高农作物产量,还能减少温室气体排放。在环境保护领域,GEMs 可以去除环境中泄漏的石油、难以降解的塑料垃圾以及有毒化学物质。
例如,传统的药物递送方式多采用非活体治疗药物,而近年来,活细胞作为治疗递送载体受到广泛关注,像益生菌用于治疗肠道疾病、罕见代谢疾病以及癌症治疗等。利用活微生物进行癌症治疗和肠道疾病治疗的理念早已有之,经过多年的发展,其优势逐渐显现,其中一个重要优势就是活微生物的靶向能力。

二、GEMs 的生物遏制技术

为确保 GEMs 的安全应用,无论其应用于人体、土壤还是污染水体等环境,最终都需要对其进行有效遏制。虽然物理遏制是一种选择,但当部署带有基因编码生物遏制电路的 GEMs 时,能更好地发挥其功能。目前,已经开发出多种基因编码的生物遏制策略。
其中一种常用的方法是利用营养缺陷型。以治疗苯丙酮尿症(Phenylketonuria,PKU)的益生菌菌株 SYNB1618 为例,Synlogic Inc. 公司使用了一种敲除dapA基因的工程菌株。由于该基因的缺失,这种菌株必须依赖外源二氨基庚二酸才能生存。这种营养缺陷型方法虽然简单,但存在一定局限性,比如相应的化学物质可能在环境中难以获取或成本较高。

三、GEMs 在自然环境中的适应性

微生物在漫长的进化过程中,已经适应了各自的生存环境,达到了生态平衡。相比之下,含有人类定义功能(如治疗 PKU)的 GEMs,通常在自然环境中的适应性不如本地微生物,除非其工程化功能能够提供增强的适应性优势,例如比天然蓝藻具有更高的光合作用效率。即便适应性相对较差,有研究表明,GEMs 在土壤或地表水微观生态系统中仍能存活数月之久。这就引发了人们对其在自然环境中可能产生的长期影响的担忧,比如是否会影响生态平衡、是否会与本地微生物发生基因交换等。

四、GEMs 应用的监管考量

自 1975 年阿西洛马会议广泛讨论 GEMs 相关问题以来,各国政府陆续制定并实施了一系列指导方针和法规。例如,美国国立卫生研究院(National Institutes of Health,NIH)在 1976 年发布了《重组 DNA 指南》。根据 NIH 的指南,GEMs 的逃逸率(定义为在非许可或致死条件下的细胞数量与许可条件下的细胞数量之比)应控制在 10-8。1985 年,关于 GEMs 的野外释放也有了相应规定。这些监管措施旨在确保 GEMs 的安全应用,平衡其潜在益处与可能带来的风险。

五、GEMs 的未来展望

随着合成生物学技术的不断进步,为 GEMs 的安全部署提供了更有力的保障,其在解决全球性问题方面的潜力不可估量。然而,要充分实现 GEMs 的应用价值,还需要考虑诸多非技术因素。
研究人员需要深入了解 GEMs 的复杂特性、潜在风险和益处。科学和工程教育工作者在教学过程中,不能仅仅侧重于传授技术知识,还应引导学生关注 GEMs 的社会、伦理和环境影响。公众对 GEMs 的认知和接受程度也至关重要,需要通过有效的科普宣传,提高公众对 GEMs 的了解,减少不必要的担忧和误解。
此外,跨学科的合作也必不可少。生命科学、工程学、环境科学、社会学等多学科的专家应共同合作,从不同角度研究和评估 GEMs,制定更加科学合理的发展策略和监管措施。只有综合考虑技术和非技术因素,GEMs 才能在保障人类健康和解决全球性问题方面发挥更大的作用,为人类创造更美好的未来。
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