《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》:Digital PCR-based genetic profiling from vitreous fluid as liquid biopsy for primary uveal melanoma: a proof-of-concept study

【字体: 时间:2025年04月18日 来源:Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 11.4

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  编辑推荐:葡萄膜黑色素瘤(UM)的早期分子分型对预后至关重要,但传统肿瘤活检存在侵入性风险。荷兰莱顿大学团队通过数字PCR(dPCR)分析65例玻璃体液(vfDNA),成功在69%样本中检出肿瘤来源DNA(含GNAQ/GNA11等驱动突变),45%病例可推断预后相关分子亚型(如BAP1/SF3B1/EIF1AX突变及3p/8q拷贝数变异),为无创液体活检提供新策略,发表于《Journal of Experimental》。

葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma, UM)是一种起源于眼内黑色素细胞的侵袭性肿瘤,尽管罕见,却是成人最常见的原发性眼内恶性肿瘤。其特殊之处在于,即使原发灶得到有效控制,约半数患者仍会因早期微转移而预后不良。传统上,分子分型依赖肿瘤组织活检,但眼内操作不仅需要高超的手术技巧,还可能引发视网膜脱离、出血等并发症。更棘手的是,约80%的UM患者选择保留眼球的放射治疗,无法直接获取肿瘤样本。如何通过更安全的方式获取肿瘤分子信息,成为临床亟待解决的难题。

荷兰莱顿大学医学中心的R.J. Nell团队在《Journal of Experimental》发表了一项开创性研究,首次系统评估了玻璃体液(vitreous fluid)作为液体活检来源的潜力。他们利用高灵敏度的微滴式数字PCR(ddPCR)技术,对65例UM患者玻璃体液中的DNA(vfDNA)进行全面分析,包括Gα信号通路驱动突变(GNAQ/GNA11/CYSLTR2/PLCB4)、预后相关BSE突变(BAP1/SF3B1/EIF1AX)以及染色体3p/8q拷贝数变异(CNAs)。

研究团队采用多项关键技术:1)通过Quick-cfDNA试剂盒从100-200 μL玻璃体液中提取DNA;2)设计靶向及drop-off(缺失检测)dPCR assays检测低频突变;3)创新性结合经典法(PPARG/PTK2 vs. TERT/TTC5)和SNP法(如rs6617/rs7843014)量化CNAs;4)利用in silico模拟预测检测限,避免假阴性。样本队列来自莱顿大学医学中心生物库,均为手术摘除眼球的UM患者,确保与原发肿瘤分子数据(既往研究)直接比对。

结果部分揭示三大核心发现:

  1. 玻璃体液DNA的组成特征:63/65样本检出DNA,其中45例(69%)含肿瘤来源DNA(中位比例15.5%),其浓度与肿瘤突出高度显著正相关(Spearman rho=0.46, p=0.001),提示肿瘤体积越大,释放至玻璃体的DNA越多。

  2. 分子分型的可行性:在vfDNA+/UM+样本中,88%(15/17)检出BSE突变,90%(19/21和18/20)的3p/8q CNAs与原发瘤一致。值得注意的是,未检出的CNAs均对应原发瘤中的亚克隆变异,凸显dPCR对克隆性改变的敏感性。

  3. 临床关联性:基于vfDNA的分子分型(如BAP1突变/3p缺失组)成功预测患者预后(log-rank p=0.009),中位生存期5.8年 vs. 未达到(EIF1AX/SF3B1突变组),与组织活检结果高度一致。

讨论部分指出,该研究首次证明玻璃体液可作为UM分子分型的可靠液体活检来源,尤其对无法获取肿瘤组织的患者具有转化价值。局限性在于当前样本均来自晚期(需摘除眼球)病例,未来需在前瞻性临床验证中优化检测流程(如预筛选高肿瘤厚度患者)。技术层面,SNP法比经典法更精准,而drop-off assay(如EIF1AX外显子1/2通用检测)为无热点突变提供新思路。研究还拓展了dPCR在稀缺样本分析中的应用范式,包括通过模拟实验规避统计学效能不足的样本,这一策略可推广至其他癌种。

这项研究为UM的精准诊疗开辟了新途径:通过门诊常规玻璃体穿刺即可获取预后信息,避免侵入性活检风险。随着靶向治疗(如Tebentafusp)的兴起,早期分子分型将直接影响临床决策。未来方向包括联合表观遗传标记(如BAP1甲基化)提高检出率,以及探索血液等其他体液活检的互补价值。

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