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藜麦C2H2型锌指蛋白转录因子家族的全基因组鉴定及在淹水胁迫中的表达调控机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年04月22日 来源:Genetic Resources and Crop Evolution 1.6
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针对藜麦锌指蛋白家族(ZFP)研究不足的问题,研究人员通过基因组数据库筛选鉴定出60个C2H2型ZFP成员,解析其启动子区含有响应胁迫和激素的顺式作用元件,结合转录组和RT-qPCR证实高抗性材料在淹水胁迫下表达量显著升高,为藜麦抗涝品种选育提供理论依据。
锌指蛋白转录因子(Zinc-finger protein, ZFP)作为具有特殊结构域的调控蛋白,广泛参与植物生长发育及非生物胁迫响应。本研究基于藜麦基因组数据,系统鉴定出60个C2H2型ZFP家族成员,通过进化分析将其划分为5个亚家族,各亚家族在锌指结构域数量、基因结构和序列特征上呈现显著差异。
启动子分析发现,藜麦C2H2基因上游2000 bp区域富含响应胁迫和激素的顺式调控元件。转录组测序与实时荧光定量PCR(RT-qPCR)结果显示,淹水胁迫下高抗性材料的基因表达水平显著高于敏感材料。值得注意的是,这些基因表现出明显的组织特异性表达模式,暗示C2H2基因可能通过被淹水胁迫诱导表达,进而参与藜麦的耐涝调控网络。
该研究不仅阐明了藜麦C2H2-ZFP家族的基本特征,更揭示了其在淹水胁迫中的潜在功能,为耐涝藜麦品种的分子设计育种奠定了理论基础。
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