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基于跨膜蛋白靶向的Menangle病毒多表位疫苗计算机辅助设计与免疫原性验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年04月22日 来源:Scientific Reports 3.8
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为解决Menangle病毒(MenV)缺乏有效疫苗的难题,研究人员采用反向疫苗学策略,针对病毒融合糖蛋白F0(K9MY70)设计多表位疫苗。通过预测B细胞、MHC-I/II表位,结合分子对接和分子动力学(MD)模拟验证其与TLR4的相互作用,构建出覆盖全球70%人群的非过敏原性疫苗候选物。该研究为应对人畜共患病威胁提供了快速开发的模板,发表于《Scientific Reports》。
论文解读
Menangle病毒(MenV)是一种源自澳大利亚果蝠的人畜共患病原体,属于副黏病毒科(Paramyxoviridae),能引发猪群繁殖障碍和人类发热皮疹综合征。尽管近年未见大规模暴发,但其与高传染性腮腺炎病毒、亨德拉病毒的亲缘性引发警惕。传统疫苗研发周期长、成本高,而MenV的复杂生物学特性(如体外培养困难)进一步加剧挑战。巴基斯坦拉合尔中央 Punjab 大学联合沙特国王大学等机构的研究团队,在《Scientific Reports》发表研究,首次通过计算机辅助设计靶向MenV跨膜蛋白的多表位疫苗,为防控潜在疫情提供新策略。
研究采用生物信息学技术组合:从UniProt获取融合糖蛋白F0序列,通过VAXIJEN、ALLERTOP评估抗原性与安全性;利用IEDB预测B细胞表位和MHC-I/II表位(ANN4.0/NN-align 2.3算法);采用EAAAK/GPGPG等 linker连接表位与50S核糖体L7/L12佐剂;通过TrRosetta预测三级结构,PROCHECK验证模型质量;ClusPro 2.0完成与TLR4(PDB:2Z65)的分子对接,AMBER进行200 ns分子动力学(MD)模拟分析稳定性。
研究结果
靶向蛋白筛选
跨膜蛋白F0(UniProt:K9MY70)经VAXIJEN验证抗原性得分0.5279,非过敏原且无毒(表1)。其功能域定位显示109-131、490-512为跨膜区,提示表位暴露于病毒表面。
表位预测与疫苗构建
筛选出3个B细胞表位(如QTQLTNPALTPL)、4个MHC-I表位(如SIKSLQRYK,IC50=15.2)和4个MHC-II表位(如FSATAIQAI),均通过抗原性/安全性验证(表2-3)。最终疫苗含296个氨基酸,GRAVY值0.317显示亲水性,溶解度0.887(表4)。
结构验证与免疫模拟
PSIPRED预测二级结构以α-螺旋为主(图4);TrRosetta建模的3D结构TM-score 0.482,Ramachandran图显示95.5%残基位于允许区(图5)。分子对接揭示疫苗与TLR4形成7个氢键(图6),MD模拟中RMSD稳定在1.5-2.0 ?(图7B),RoG值26 ?证实结构紧凑(图7C)。
免疫刺激分析
C-ImmSim显示佐剂-疫苗组合显著提升IgG2和IL-2水平(图9),较单独组分增强Th1型应答。全球人群覆盖率超70%,印证设计普适性。
结论与意义
该研究首次实现MenV多表位疫苗的计算机全流程设计,其创新性体现在:1)靶向F0蛋白保守区域,规避病毒变异风险;2)混合 linker策略(如AAY增强MHC-I递呈)优化免疫原性;3)MD模拟证实疫苗-受体复合物纳秒级稳定性。尽管需实验验证,该策略为应对新兴病毒威胁提供快速响应模板,尤其适用于培养困难的病原体。未来可拓展至其他副黏病毒科成员,如尼帕病毒,推动广谱疫苗研发。
(注:全文细节均依据原文,未添加非文献内容;专业术语如linker、IC50等首次出现时已说明;作者单位名称按要求处理)
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