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这篇研究聚焦多发性硬化(MS)与肠道菌群的关系。通过对 MS 异卵双胞胎研究,发现 51 种差异微生物。将双胞胎回肠菌群移植到无菌转基因小鼠,证实 MS 患者回肠菌群更易诱发实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE),锁定毛螺菌科的两种细菌可能是致病关键。
多发性硬化与肠道菌群的研究
研究背景
多发性硬化(MS)是中枢神经系统(CNS)最常见的炎症性脱髓鞘疾病。其发病与遗传易感性和多种环境因素有关,如超过 200 种常见 DNA 变异,以及吸烟、维生素 D 缺乏、肥胖、感染爱泼斯坦 - 巴尔病毒(EBV)等。近年来,共生肠道微生物也被认为可能是诱发疾病的因素。大量基于人群的研究显示,MS 患者肠道微生物组成发生变化,但不同研究结果差异较大,且多数研究仅为描述性,缺乏对 MS 相关微生物功能机制的深入探究。
将粪便样本转移到无菌(GF)转基因小鼠中,可探究肠道微生物与 MS 的关系。RR 品系转基因小鼠表达识别髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG)的受体,在特定病原体自由(SPF)条件下会自发发展为类似 MS 早期阶段的炎症性脱髓鞘中枢神经系统疾病,即实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE);而在 GF 条件下则几乎完全健康。给 GF 转基因小鼠定植健康 SPF 小鼠的微生物群或人类粪便微生物群,可诱导 EAE 发生,且 MS 患者粪便样本诱导疾病的效率更高。此前研究虽表明 MS 来源的肠道微生物群与中枢神经系统自身免疫疾病的启动有关,但未明确致病细菌种类及其在肠道中的位置。
研究方法
- 动物:实验使用 RR 小鼠(TCR1640小鼠),其携带针对 MOG96 - 105肽的转基因 TCR,背景为 SJL/J。小鼠饲养和繁殖于德国慕尼黑工业大学 ZIEL - 食品与健康研究所的无菌设施中,动物实验遵循动物福利法规,并经巴伐利亚州动物伦理委员会批准。
- MS 双胞胎队列和研究设计:研究中的 MS 双胞胎队列来自德国慕尼黑大学医院临床神经免疫学研究所的 MS TWIN STUDY,该队列已招募 101 对 MS 异卵双胞胎。本研究选取 81 对双胞胎的冷冻粪便样本,用 QIAamp PowerFecal DNA 试剂盒处理,在 Illumina Miseq 系统上对细菌 16S rRNA 基因的 V3 - V4 可变区进行扩增和测序。同时,4 对双胞胎同意进行肠镜检查,采集末端回肠、结肠和粪便的微生物样本。肠镜采样在标准清洁程序后进行,采集的黏膜活检组织和肠道液体样本在厌氧条件下处理并保存于 - 80°C。所有研究程序均经当地伦理委员会批准,患者均签署书面知情同意书。
- 无菌小鼠的细菌定植:在厌氧条件下将细菌上清液转移到 Hungate 管中,8 周龄的无菌 RR 小鼠经口灌胃 100 μL 回肠细菌悬液(约 2×106个细菌细胞)。定植 2 周和实验终点时收集粪便样本,12 周后或小鼠出现麻痹症状时处死小鼠。根据特定评分标准监测小鼠 EAE 临床症状。
- 统计分析:使用 GraphPad Prism 7 进行统计分析。两组比较(如最大 EAE 评分、抗 MOG IgG 水平等)采用两尾无配对学生 t 检验;多组比较(如不同肠道部位的 α 多样性等)采用单因素方差分析(ANOVA)和 Tukey 多重比较检验,P 值 < 0.05 视为有统计学意义。
研究结果
- MS 异卵双胞胎的粪便微生物组:对 81 对 MS 异卵双胞胎粪便样本进行 16S rRNA 扩增子测序分析,发现 α 和 β 多样性在患病和未患病双胞胎之间无显著差异。通过线性混合模型(LMM)和卡方分析,共鉴定出 51 种差异丰富的分类群。其中,丙酸产生菌 Dialister succinatiphilus 和 Prevotella buccae 在 MS 双胞胎中显著减少;不能将色氨酸转化为吲哚的 Alistipes ihumii 显著增加,而吲哚具有免疫调节特性。此外,厚壁菌门(Firmicutes)中的多个分类群显著增加,如 Copromonas、Acutalibacter、Anaerotruncus massiliensis 等,Eisenbergiella tayi 也是显著增加的物种之一。
- MS 异卵双胞胎肠道中的位点特异性微生物特征:选取 4 对双胞胎进行肠镜采样,分析不同肠道部位(末端回肠、结肠的管腔和黏膜,以及粪便)的微生物组成。结果显示,不同肠道部位的 α 多样性在 MS 患者和健康双胞胎之间无显著差异,β 多样性也无显著差异。但在属水平上,不同肠道部位的微生物组成存在差异,如 Escherichia/Shigella 在肠镜获取的管腔微生物群中含量高,在粪便中则很少。同一双胞胎对中微生物组成的相似性高于不同个体。
- MS 来源的回肠微生物群定植引发 EAE:选择一对差异明显的双胞胎(MS - Q 和 HT - Q),将 MS - Q 的末端回肠样本转移到 GF RR 小鼠中。结果发现,部分小鼠在定植 4 - 12 周后自发出现 EAE,且患病动物均为雌性。患病小鼠出现典型 EAE 症状,如尾巴和后肢麻痹、脊髓细胞浸润和脱髓鞘等。定植小鼠血清中抗 MOG IgG1 抗体滴度显著升高,脾脏中 IL - 17 产生的 CD4+T 细胞比例有增加趋势,IFNγ+CD4+T 细胞比例有下降趋势。微生物定植还导致小鼠盲肠和近端结肠出现淋巴细胞浸润,提示存在轻度肠道炎症。对小鼠粪便和回肠微生物群分析发现,患病小鼠中 Eisenbergiella tayi 显著增加,且在实验后期更为明显,同时其他细菌属如 Akkermansia 和 Erysipelatoclostridium 减少。
- MS 与健康双胞胎回肠微生物群定植的比较:将 MS - Q 和 HT - Q 的回肠样本分别定植到 GF RR 小鼠中。结果显示,接受 MS - Q 回肠样本的小鼠中,5 只雌性和 0 只雄性发病,而接受 HT - Q 回肠样本的小鼠均未发病。接受 MS - Q 回肠样本的小鼠脾脏中 Th17 细胞显著增加,Foxp3+Tregs 有减少趋势,且肠道出现淋巴细胞浸润。微生物群分析发现,接受 MS - Q 回肠样本的小鼠中,Lachnoclostridium 在实验终点显著增加,而接受 HT - Q 回肠样本的小鼠微生物群组成相对稳定。
- 雄性 MS 双胞胎回肠样本定植小鼠中毛螺菌科的扩张:选择另一对双胞胎(MS - A 和 HT - A)进行定植实验,MS - A 为男性,疾病活动度低且在接受干扰素 - β 治疗。结果显示,接受 MS - A 回肠样本的小鼠中,6 只雌性和 1 只雄性发病,接受 HT - A 回肠样本的小鼠中,2 只雌性和 0 只雄性发病。接受 MS - A 回肠样本的小鼠在实验终点时 Lachnoclostridium 显著增加,而接受 HT - A 回肠样本的小鼠中 Staphylococcus 在实验终点扩张,但与 EAE 发病率无关。
讨论
本研究利用人 - 鼠转移模型,确定了来自 MS 患者小肠的两种致病肠道细菌 ——Eisenbergiella tayi 和 Lachnoclostridium,它们均属于毛螺菌科。研究策略包括比较同卵双胞胎的微生物群、检测小肠微生物群、在体内模型中测试细菌的自身免疫潜力。此前研究受样本和环境因素影响,结果不一致,本研究通过比较 MS 异卵双胞胎减少了混杂因素,同时还鉴定出一些新的差异分类群。
多数研究仅依赖粪便样本,本研究还对末端回肠和结肠进行采样,考虑了肠道不同部位的免疫功能差异。经典关联研究未明确疾病相关细菌的功能,本研究使用自发 EAE 模型,更准确地探究了肠道微生物与 MS 的功能关系。虽然本研究发现 MS 患者回肠样本定植小鼠中 EAE 发病率最高,且患病小鼠中毛螺菌科细菌显著扩张,但仍需进一步实验验证其致病性。
Eisenbergiella tayi 和 Lachnoclostridium 在人类样本中是次要成分,但在小鼠中却能引发 EAE,可能与细菌生物膜形成有关。这两种细菌在肠道中的功能及与肠道相关淋巴组织(GALT)的相互作用仍存在争议,其引发 EAE 的机制可能包括抗原模拟、调节 T 细胞反应等。此外,EAE 发病率在雌性小鼠中更高,与人类 MS 中女性优势现象相似,但其性别差异的机制尚不清楚。
人 - 鼠转移模型存在局限性,如人和小鼠免疫系统、肠道微环境和生活方式不同,但目前仍是研究疾病相关微生物组改变的有效模型。RR 小鼠模型虽能模拟人类 MS 的一些特征,但也存在差异,如 MS 患者的靶自身抗原更复杂。
展望与结论
本研究通过对 MS 异卵双胞胎粪便微生物群研究,结合肠镜采样和小鼠定植实验,发现回肠中的 Eisenbergiella tayi 和 Lachnoclostridium 可能是触发临床疾病的潜在因素。但研究存在局限性,如肠镜采样的双胞胎数量有限、物种间生理和免疫反应差异等。未来研究需扩大样本量,进一步明确这些细菌在人类 MS 中的作用。如果肠道微生物在 MS 中的作用得到证实,有望开发通过调节微生物组治疗 MS 的新方法。目前研究处于初步阶段,未来类似研究将更全面地揭示 MS 与肠道微生物的关系。