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在药物研发和安全用药中,药物 - 药物相互作用(DDI)预测意义重大。现有方法存在诸多局限,如无法处理复杂信息、稳健性差等。研究人员提出 Fuzzy - DDI 模型,实验表明该模型在 DDI 预测任务上表现优异,为相关研究和应用提供新方向。
在医疗领域,药物治疗是常见手段,但患者同时服用多种药物时,药物之间会 “相互影响”,这就是药物 - 药物相互作用(Drug - drug interactions,DDI)。DDI 可能降低药效,甚至危害患者健康。例如,日常使用的抗菌药物阿莫西林和林可霉素,不同剂量搭配会产生不同效果,低剂量时二者相互抑制,药效降低;高剂量时阿莫西林会促进林可霉素代谢,增加其毒性反应。
传统确定 DDI 的湿实验室方法,就像在黑暗中摸索,不仅昂贵,而且耗时,因为生物分子间的相互作用极为复杂。近年来,计算方法虽广泛用于 DDI 预测,但也问题重重。基于知识的方法,依赖专家定义知识构建模型,获取和维护知识需耗费大量人力,扩展性受限;基于机器学习的方法,虽能利用算法训练模型,但难以充分挖掘药物数据中的语义知识;基于网络的方法,需要大量标记训练数据,泛化能力有限,处理小样本任务时效果不佳。而且,现有方法普遍存在三个固有缺陷:依赖二元运算,难以处理稀疏或噪声数据;多为黑箱模型,难以解释预测结果;仅关注药物对间的简单相互作用,忽略药物剂量、靶细胞类型等重要医学因素。
为解决这些问题,大连海事大学的研究人员开展了深入研究。他们提出一种新的稳健模糊逻辑查询模型 ——Fuzzy - DDI,用于在各种复杂条件下预测 DDI。该研究成果发表在《Artificial Intelligence in Medicine》上,为药物研发和安全用药带来了新的曙光。
研究人员在研究中运用了多种关键技术方法。在任务实施方面,将药物视为查询中的实体,把药物相关信息当作关系投影,把数据集中的知识三元组(e1,r,e2)转化为查询五元组((e1,r1),r,(e2,r2)) 。例如在多剂量 DDI 预测任务中,把药物剂量作为关系投影进行研究。同时,基于模糊集理论,利用模糊逻辑定义逻辑运算符,在推理过程中将 DDI 预测分解为关系投影和对模糊集的逻辑运算。
研究结果
- 复杂任务预测能力:Fuzzy - DDI 可处理包含其他医学信息的复杂预测任务。以多剂量 DDI 预测任务为例,研究人员研究不同剂量药物共同使用产生的联合效应,将药物剂量作为关系投影,成功将传统的三元组转化为更复杂的查询五元组,完成了现有方法难以完成的任务,验证了其在复杂条件下的推理能力。
- 模型稳健性探究:研究人员通过模拟噪声实验(向训练数据中添加一定比例的错误样本)和缺失样本实验(随机丢弃部分正确样本),评估 Fuzzy - DDI 在复杂条件下的稳健性。结果表明,该模型在处理噪声和缺失样本数据时表现出色,展现出良好的容错性和稳健性。
- 综合性能评估:在三个基准数据集上进行实验,Fuzzy - DDI 在各种 DDI 预测任务上均显著优于当前最先进的方法,这充分证明了其有效推理能力、容错性和稳健性。
研究结论与讨论
Fuzzy - DDI 模型的提出是药物 - 药物相互作用预测领域的重要突破。该模型基于模糊逻辑,将复杂的 DDI 预测查询分解为关系投影和模糊集上的逻辑运算,提高了模型的稳健性,能够处理包含其他医学实体的复杂预测任务,这是现有方法难以做到的。其在噪声和缺失样本环境下的良好表现,为实际应用提供了更可靠的保障。
在未来的研究中,Fuzzy - DDI 模型有望进一步优化,拓展其在更多复杂医学场景中的应用。例如,可以考虑纳入更多种类的医学信息,如基因数据、患者个体差异等,进一步提升预测的准确性和全面性。同时,该模型的成功也为其他生物医学领域的研究提供了新思路,推动相关领域朝着更加精准、高效的方向发展。总之,Fuzzy - DDI 模型的出现,为药物研发、临床合理用药等方面提供了有力的技术支持,具有重要的理论意义和实际应用价值。