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空间糖组学与糖蛋白质组学的技术创新与应用:解析疾病糖基化图谱的新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年04月22日 来源:BBA Advances
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本研究针对糖基化异常在癌症、阿尔茨海默病等疾病中的关键作用,系统综述了空间糖组学(glycomics)和糖蛋白质组学(GPomics)领域的技术突破。研究人员通过整合激光显微切割(LMD)、人工智能(AI)驱动的细胞分型、深度视觉蛋白质组学(DVP)和质谱成像(MALDI-MSI)等前沿技术,建立了从组织切片到单细胞水平的空间糖链分析体系,为发现糖生物标志物(glycobiomarkers)和开发靶向治疗提供了创新方法论。
糖链作为生命体中最重要的翻译后修饰之一,其复杂多变的分子结构被称为"糖密码",参与细胞间通讯、免疫识别等关键生物学过程。然而,由于糖链结构的非模板化合成特性(一个蛋白可携带数十种糖型)和缺乏高效分析工具,空间糖链组学研究长期滞后于基因组学和蛋白质组学。随着癌症、神经退行性疾病等领域不断发现糖基化(glycosylation)异常与疾病的密切关联,如何精确解析组织微环境中糖链的空间分布,成为破解疾病机制和开发靶向疗法的关键瓶颈。
针对这一挑战,日本的研究团队在《BBA Advances》发表综述,系统梳理了空间糖组学(glycomics)和糖蛋白质组学(GPomics)领域的技术路线。研究指出,传统方法如凝集素微阵列(LMA)虽能高通量检测糖链,但无法保留空间信息;而新兴的单细胞技术又难以捕获完整的糖蛋白信息。为此,作者提出"双轨制"解决方案:通过整合激光显微切割(LMD)、人工智能图像分析和自动化样品处理技术,构建了从组织切片到分子图谱的全链条分析体系。
关键技术包括:1)激光显微切割联合凝集素微阵列(LMD-LMA)实现0.1 mm2区域(约60个细胞)的糖谱分析;2)深度视觉蛋白质组学(DVP)通过AI驱动图像分割和超灵敏LC-MS/MS(液相色谱-串联质谱)获得空间蛋白质组背景;3)多重离子束成像(MIBI)和成像质谱流式(IMC)实现12种凝集素标记的金属同位素空间检测;4)自动化糖肽富集系统(autoSP3/LectinSP3)提升重现性。
3.1 凝集素微阵列技术突破
研究详细介绍了LMD-LMA技术的演进:从早期需要毫米级组织样本,发展到可分析5 μm厚、60细胞规模的微量样本。通过优化凝集素固定化技术和采用CMOS传感器扫描系统,检测灵敏度达纳克级,扫描时间缩短至15秒。该技术已成功应用于胃癌幽门螺杆菌感染、肝细胞癌等疾病的糖链特征图谱绘制,发现紫藤凝集素(WFA)可作为心脏纤维化的特异性探针。
3.2 AI驱动的自动化革新
团队重点分析了AI在三个环节的应用价值:1)基于Transformer算法的组织图像分割实现精确LMD定位;2)机器学习解析74种凝集素的糖链结合模式;3)自动化SP3磁珠技术实现糖肽的一管式富集。特别开发的AutoGP系统通过十通阀切换HILIC(亲水相互作用色谱)和C18柱,首次实现完整糖肽的在线分析,避免了传统方法中糖链与肽段的分离损失。
4.1 空间成像技术融合
在组织原位分析方面,研究者创新性地将凝集素引入成像质谱流式技术。通过硫醇化修饰解决了凝集素金属标记难题,开发的LectoScape方案可同步检测12种糖链和蛋白标志物,成功绘制宫颈癌组织中N-糖链和O-糖链的异质性分布。相比传统MALDI-MSI(基质辅助激光解吸电离质谱成像)仅能分析N-糖链,该方法拓展了糖链类型的检测范围。
5. 结论与展望
该研究确立了空间糖组学分析的标准化框架:1)LMD-LMA适用于微量样本的糖链特征筛查;2)IMC/MIBI适合多参数组织原位分析;3)MALDI-MSI提供非靶向糖链空间分布。通过整合这些技术,研究者构建了首个小鼠心脏衰老糖组图谱并开源共享。未来发展方向包括:开发O-糖链特异性酶解方法、扩展凝集素panel至50种以上、实现亚细胞级(<20 μm)分辨率。值得关注的是,FDA已采纳凝集素芯片(LecChip-IgG-mAb)作为抗体药物糖型质控标准,凸显该技术的临床转化潜力。
这项系统性工作为破解"糖密码"的空间生物学内涵提供了方法论基础,其技术路线不仅适用于基础研究,更为癌症早诊、抗体药物开发等临床应用开辟了新途径。随着Glycosmos等数据库的完善,空间糖组学有望成为多组学整合研究的关键拼图。
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