从红树林土壤分离的新型阿耶波多芽孢杆菌(Bacillus aryabhattai)所产木聚糖酶的分子特征、分子对接及其生物降解效率

【字体: 时间:2025年04月22日 来源:Biocatalysis and Agricultural Biotechnology 3.4

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  研究人员为解决木质纤维素生物质降解问题,开展从印度古德洛尔和本地治里红树林生态系统中分离和表征产木聚糖酶细菌的研究。结果发现 5 种菌株有显著木聚糖酶活性,还优化了产酶条件。这为生物乙醇生产等提供可持续木聚糖酶来源。

  在自然界中,植物细胞壁主要由木质纤维素组成,其中半纤维素的主要成分木聚糖是地球上含量仅次于纤维素的第二大聚合物。要实现木质纤维素化合物在自然环境中的生态友好型循环利用,以及后续生物发酵等代谢过程对其中碳氮源的有效利用,木聚糖的水解至关重要。目前,化学水解木质纤维素会产生有害副产物,而微生物产生的木聚糖酶能特异性水解木聚糖,具有环保、高效的优势。不过,挖掘高效且适用于工业生产的木聚糖酶产生菌仍是研究热点和难点。
为解决这些问题,来自印度圣约瑟夫文理学院(St. Joseph's College of Arts and Science)的研究人员开展了相关研究。他们从印度古德洛尔(Cuddalore)和本地治里(Pondicherry)的红树林生态系统中分离产木聚糖酶的细菌,并对其进行表征。研究发现,芽孢杆菌属(Bacillus)中的阿耶波多芽孢杆菌(Bacillus aryabhattai,PYMW)和枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis,PMS8)展现出较高的木聚糖酶活性。同时,确定了酶产生的最佳条件,如在 pH 8.0 时产量最高,麦芽糖和葡萄糖分别是B. aryabhattaiB. subtilis最有效的碳源,酵母提取物可提高酶产量。此外,还对木聚糖酶进行了纯化和固定化研究,分子对接研究揭示了酶 - 底物相互作用的关键信息。该研究成果为生物乙醇生产、造纸和废物管理等领域提供了可持续的木聚糖酶来源,发表在《Biocatalysis and Agricultural Biotechnology》上。

研究人员主要运用了以下关键技术方法:一是分离培养技术,从红树林土壤中采集 40 份样本,分离出 22 种细菌菌株;二是分子生物学技术,通过 16S rRNA 测序对菌株进行分子鉴定;三是酶活性检测技术,依据木聚糖水解圈筛选产木聚糖酶菌株并检测酶活性;四是优化实验,探究不同 pH 值、碳源和氮源对酶产量的影响;五是分子对接技术,研究酶与底物的相互作用。

1. 木聚糖酶产生菌的分离与筛选:研究人员从印度古德洛尔和本地治里不同红树林生态系统的土壤中采集样本,避开表层土壤,在 5 - 20cm 深度采集 40 份样本。将样本带回实验室后,在木聚糖 - 溴甲酚紫琼脂(XBWA)平板上进行培养,共分离出 22 种细菌菌株。经革兰氏染色、芽孢染色和生化测试,发现其中 4 种为革兰氏阳性球菌,16 种为革兰氏阳性杆菌,2 种为革兰氏阳性球杆菌。通过观察 XBWA 平板上木聚糖水解圈的形成,筛选出 5 种(PMS1、PMS8、PYMW、SBMS4 和 SBW1)具有显著木聚糖酶活性的菌株。
2. 菌株的分子鉴定:运用 16S rRNA 测序技术对筛选出的菌株进行分子鉴定,结果表明这些菌株均属于芽孢杆菌属(Bacillus)。其中,阿耶波多芽孢杆菌(Bacillus aryabhattai,PYMW)和枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis,PMS8)的木聚糖酶活性最高。
3. 酶产生条件的优化:研究人员探究了不同 pH 值、碳源和氮源对木聚糖酶产量的影响。结果显示,在 pH 8.0 时酶产量达到峰值。对于B. aryabhattai,麦芽糖作为碳源时酶产量最高(4.1 ± 0.2 U/mL);对于B. subtilis,葡萄糖作为碳源时酶产量最高(3.2 ± 0.2 U/mL)。在氮源方面,酵母提取物可有效提高酶产量。
4. 木聚糖酶的纯化与固定化:采用硫酸铵沉淀法对木聚糖酶进行纯化,经十二烷基硫酸钠 - 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS - PAGE)验证,该酶的分子量为 50 kDa。利用海藻酸钠珠对酶进行固定化,结果表明固定化后的酶稳定性和可重复使用性得到显著增强,更适合工业应用。
5. 分子对接研究:通过分子对接研究,深入了解了木聚糖酶与底物之间的相互作用,明确了参与木聚糖降解的关键氨基酸残基,为进一步理解酶的催化机制提供了理论依据。

研究结论表明,从红树林生态系统中成功分离并表征了产木聚糖酶的细菌,筛选出高活性菌株,优化了酶产生条件,实现了酶的纯化和固定化,并揭示了酶 - 底物相互作用机制。这些研究成果为生物乙醇生产、造纸和废物管理等行业提供了潜在的可持续木聚糖酶来源。然而,目前研究仍存在一些局限,如尚未开展大规模生产研究,酶的效率还可通过基因工程手段进一步提升。未来研究可聚焦于大规模生产工艺的开发、基因改造以提高酶的性能,以及拓展固定化木聚糖酶在工业领域的实际应用,这将有助于推动相关行业的绿色可持续发展,为解决环境和资源问题提供有力的技术支持。

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