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本文聚焦基于脂质的合成细胞(SCs),阐述其自下而上的开发技术,涵盖设计、工程、制备方法,介绍在靶向治疗、生物催化等多领域的应用,探讨面临的技术和实践挑战,展望未来发展方向,为该领域研究提供全面参考。
合成细胞(SCs)概述
合成细胞(SCs)是人工构建的生物系统,模拟自然细胞的结构和功能。与历经遗传和环境因素塑造的自然细胞不同,SCs 采用基于工程和应用导向的理性设计方法,具有可定制性,能执行特定任务,在生物技术、生物医药和能源等领域潜力巨大。其设计核心是自下而上的开发理念,通过精细调整所选组件的设计与组装,构建功能性整体,还可融入非生物组件以获得特殊特性。
SCs 的设计与工程
SCs 的设计构建类似房屋建筑规划,依据功能需求和应用目标进行。其主要由膜系统、基因电路和代谢途径三部分组成。膜系统是保护框架,如同房屋的结构外壳;遗传物质携带指令信息,类似居住者;代谢途径驱动生化过程,好比维持房屋功能的综合设施网络。例如成熟红细胞,其功能需求决定了组成成分的选择,体现了细胞的目的驱动设计。mRNA 疫苗作为人造 SCs,通过精确校准脂质体大小、修饰脂质成分,实现安全有效的遗传物质递送。脂质膜系统在保护内部组件和递送内容物方面至关重要,但要实现完整功能,还需整合基因电路、代谢途径等模块。
膜系统的自下而上制备技术
脂质是构建 SCs 膜系统的常用材料,其次是嵌段共聚物、蛋白质和核苷酸基结构。膜的形成依赖分子组件的自组装,其功能与组件的堆积效率相关。非脂质膜的 SCs 常存在小分子渗透性或生物相容性问题,而脂质膜凭借膜蛋白具有选择性渗透性。不过,将分子封装在膜系统内并非易事。
- 薄膜水化技术(TFH):TFH 是一种高效且具成本效益的制备 SCs 的方法,能实现一定的重复性。通过水合干燥的脂质薄膜,再经涡旋、超声或挤出等处理,可得到大小均一的脂质纳米颗粒(LNPs)。近期研究表明,顺序水化能显著提高该方法的封装效率(EE),但对大分子(>1000 Da)的 EE 仍较低且不稳定,还存在通量低和可扩展性差的问题。TFH 虽能制备多种脂质组成的膜系统,但在封装大生物分子时存在局限,需探索其他技术提升其 EE。
- 液滴转移技术:液滴转移方法是推进 SCs 设计的重要技术,通过将含功能组件的水包油(W/O)液滴从油相转移到水相,形成双层膜。该技术可制备 100 nm 至 50 μm 大小的 SCs,能满足 SCs 开发的多项参数要求,已成功封装多种生物分子,构建出复杂的 SCs。然而,该方法在微量滴定板或 Eppendorf? 管中操作时,可扩展性受限,尽管微流控技术能改善液滴大小均一性,但连续液滴界面交叉封装(cDICE)等变体方法仍存在大小均一性不足的问题,未来可探索膜乳化技术提升其性能。
- 微流控技术:微流控技术在 SCs 开发中至关重要,具有高 EE、窄多分散性和出色的可扩展性。
- 反溶剂沉淀法:反溶剂沉淀法可用于制备纳米级脂质体,如基于该技术开发的 COVID 疫苗脂质体平均粒径约 90 nm 。但并非所有分子都能耐受乙醇或异丙醇,蛋白质 / 酶等生物分子易在该过程中变性,限制了其用于构建更复杂 SCs 的可行性。不过,该技术可将预制纳米级脂质体封装在 LNPs 内,未来有望通过在预制脂质体中整合功能蛋白 / 酶制备先进 SCs,同时,无溶剂工艺也在探索中以提高生物相容性。
- 基于液滴微流控的双乳液模板法:液滴微流控可制备微米或细胞大小的 SCs,微流控制造技术的进步使双乳液的制备取得进展,能产生多种类型的双乳液,推动 SCs 从简单囊泡向复杂的类似真核细胞的隔室化结构转变。但该方法使用的有机溶剂会带来生物相容性问题,胆固醇在脂质双分子层中的分配也存在争议,不过,随着技术改进,如减少表面活性剂使用、进行生物相容性检测等,越来越多研究者采用该技术设计复杂的 SCs。
功能性 SCs
设计功能性 SCs 需整合多种模拟自然细胞关键组件和过程的模块,包括基因电路、代谢途径和亚隔室,这些模块协同赋予 SCs 功能并实现应用,主要应用领域如下:
- 靶向治疗:具有靶向能力的 SCs 可携带传统药物、蛋白质、RNA 衍生物和 CRISPR 技术等,用于治疗癌症、心血管疾病和抑制炎症通路等。它们能精准地与靶细胞结合,实现高效的药物递送,提高治疗效果。
- 表达治疗药物的 SCs:纯化的无细胞基因表达系统(CFES)推动了表达 mRNA、生长因子或膜孔蛋白等治疗药物的 SCs 的发展。这些 SCs 可用于组织再生和重塑,且能对外部刺激作出响应,在动物模型中引发的免疫反应极小,具有良好的体内应用前景。
- 生物催化:SCs 工程的进展使 SC 驱动的催化成为可能,能实现碳固定、甲醇基生物制造、碳水化合物合成和脂质合成等。通过在 SCs 内整合单种或多种酶,或使酶结合在脂质头部基团上,可构建高效的生物催化体系,还能将复杂的能量转换组件结合,制备人工能量电池。
- 生物传感器:SCs 可作为生物传感器,利用酶进行底物转化和检测,或通过刺激响应性基因表达实现检测功能。亚隔室的存在能稳定酶的环境,提高催化效率,特定脂质类型的膜可触发释放淬灭染料,增强检测的多样性和灵敏性。
面临的挑战
尽管 SCs 在实际应用中前景广阔,但仍面临技术和实践两方面的挑战。
- 技术挑战:在制剂开发方面,除了含 mRNA 和标准药物的 SCs,含有 CFES 和酶的复杂 SCs 尚未针对实际应用进行配方设计,需改进长期稳定性和功能完整性的配方策略。稳定性方面,纳米和微米尺寸的 SCs 都需满足长期稳定性要求,双乳液模板法制备的 SCs 易受渗透压影响,脂质膜也对渗透压敏感,可通过使用聚合物或生物聚合物增强结构完整性。渗漏问题也不容忽视,表面活性剂技术的进步有望改善脂质膜的稳定性,减少渗漏。此外,大规模生产是一大难题,需要将复杂的制备工艺转化为工业规模,同时确保产品质量、可重复性和经济可行性,目前用于复杂微米级 SCs 生产的设备大多未达到药品生产质量管理规范(GMP)标准,不符合监管要求。
- 实践挑战:安全性和伦理研究对 SCs 应用至关重要,基于 CRISPR 的 SCs 和含 CFES 的 SCs 可能对公众和环境产生未知影响,目前缺乏严格的监管框架,而生物技术创新的安全、有效和伦理使用要求复杂,合规难度大。公众认知也是一个挑战,SCs 的广泛接受依赖于通过透明沟通、教育和伦理责任建立公众信任,基因表达和编辑的 SCs 尤其需要加强监管。成本效益是决定 SCs 可及性和可扩展性的关键因素,目前实验室规模生产的方法在转化为大规模生产时,研发成本较高,需各方协作解决这些问题。
结论与展望
传统的 SCs 制备方法如 TFH 成本低,但存在异质性和 EE 有限的问题;先进技术如液滴转移和微流控技术在控制囊泡大小、封装和可重复性方面表现优异,但存在初始成本高和操作复杂的问题,其中微流控技术是设计实用 SCs 最具前景的方法。目前 SCs 在 LNP 生产中已展现价值,但稳定的商业配方尚未形成。微流控技术存在油残留影响生物相容性、脂质分配不均和缺乏合规生产设备等问题,需要进一步研究改进。液滴转移方法可探索膜乳化技术提升均一性和通量。未来,SCs 的发展需优化配方以延长保质期,实现从微米到纳米尺度的转变,开发符合 GMP 标准的大规模生产设备。同时,可通过整合膜孔蛋白等策略设计更稳健的 SCs,利用系统化学和人工智能(AI)技术加速设计过程,AI 可在设计优化、建模、预测和自动化实验等方面发挥重要作用,推动 SCs 技术发展,解决 21 世纪的复杂挑战,但在发展过程中需注重安全、透明和公众参与。