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自分泌运动因子(ATX)与多种疾病相关,其信号通路中产生的溶血磷脂酸(LPA)在疾病发展中起关键作用。为开发更有效的 ATX 抑制剂,研究人员设计合成新型抑制剂。结果发现 “type VI” 抑制剂活性增强,且具新结合模式,为相关疾病治疗带来新希望。
在生命科学和医学领域,自分泌运动因子(Autotaxin,ATX)的研究一直备受关注。ATX 属于外核苷酸焦磷酸酶 / 磷酸二酯酶(ENPP)家族,它能水解溶血磷脂酰胆碱(LPC)产生具有生理活性的溶血磷脂酸(LPA)。LPA 与两类 G 蛋白偶联受体(GPCRs),即 LPA
1 - 3和 LPA
4 - 6结合后,会引发一系列细胞反应,如细胞因子分泌、细胞分化、迁移、增殖和存活等。然而,ATX/LPA 信号通路的失调与多种病理状况密切相关,像纤维化和癌症等疾病的发生发展都与之有关。
此前,虽然已经有针对 ATX 的抑制剂研究,并且根据其与 ATX 三方位点(活性位点、口袋和通道)的结合模式将抑制剂分为五类(I - V),但这些抑制剂在临床试验中的表现并不理想。例如,IV 型抑制剂 ziritaxestat 在治疗特发性肺纤维化(IPF)和系统性硬化症的临床试验中,因风险 - 收益比不理想而提前终止。这表明现有的抑制剂可能存在一些局限性,亟待开发新的、更有效的 ATX 抑制剂。
为了解决这些问题,来自 Galapagos 等研究机构的研究人员开展了一项关于设计、合成具有三点锁定结合模式的 ATX 抑制剂的研究。该研究成果发表在《Bioorganic 》上,为相关疾病的治疗带来了新的希望。
研究人员在开展此项研究时,运用了多种关键技术方法。在化合物合成方面,通过设计新的合成路线来制备不同结构的化合物;利用 X 射线晶体学技术测定化合物与 ATX 的共晶结构,以明确抑制剂的结合模式;采用生化测定法监测化合物对 ATX 催化 LPC 转化为 LPA 的抑制活性;借助细胞实验,如 NIH 3T3 细胞迁移实验和 AKT、ERK1/2 磷酸化检测,评估抑制剂的细胞活性和对相关信号通路的影响;还进行了大鼠血浆实验,监测化合物对血浆中 LPA 生成的抑制作用 。
下面详细介绍研究结果:
- 设计:研究人员基于 IV 型抑制剂 GLPG1690 及其类似物与 ATX 结合的晶体结构,发现咪唑并 [1,2 - b] 哒嗪或咪唑并 [1,2 - a] 吡啶支架 2 位的乙基指向活性位点。为开发新的三点锁定机制抑制剂,他们计划扩展乙基大小并连接能与锌原子结合的基团,如羧酸、苯并恶唑烷酮部分等。为此,他们开发了新的合成路线,用肉桂醛替代丙醛,以便后期对 2 位取代基进行结构修饰。
- 化学:研究人员成功合成了一系列化合物,包括带有不同连接基团和取代基的 ATX 抑制剂。他们先合成了对照化合物 3,之后通过多步反应制备了关键中间体,如带有苯乙烯基的 7、带有醛基的 10 等,并进一步合成了具有亚甲基、乙烯基和丙烯基连接的多种化合物,详细的反应条件和产率都有明确记录。
- 构效关系(SAR):研究人员以 4 - 氟苯基噻唑部分和特定取代基在咪唑并 [1,2 - b] 哒嗪支架 6 位进行构效关系研究。通过生化测定法检测化合物对 ATX 催化 LPC 转化为 LPA 的抑制活性,发现一些取代基能提高化合物的活性。例如,带有腈基(29)或苯并恶唑烷酮羧酰胺部分(4 和 41)的化合物活性显著提升,其中 4 和 41 的抑制活性比对照化合物 3 高约 40 倍 。
- 与 ATX 的共晶结构:为探究化合物活性提升的原因,研究人员对 29、4、41 和 25 与大鼠 ATX 进行共结晶,并通过 X 射线晶体学测定其结构。结果表明,29 虽能与 Trp275形成氢键提高活性,但未延伸至活性位点,属于 IV 型抑制剂;而 4、25 和 41 能占据 ATX 三方位点的所有三个口袋,形成新的 VI 型抑制剂。其中,4 和 41 的结构特点使其能与关键氨基酸残基形成稳定的相互作用,从而增强抑制活性 。
- 表型活性:研究人员对 4 和 41 进行表型活性研究,与之前的 IV 型抑制剂 ziritaxestat 对比。在细胞实验中,4 和 41 显著降低 NIH 3T3 细胞迁移,且对 ERK1/2 和 AKT 信号通路的抑制作用更强;在大鼠血浆实验中,4 和 41 也表现出很强的抑制 LPA 生成的活性,在血浆浓度高于 10 nM 时抑制率超过 50% 。
研究结论和讨论部分指出,研究人员成功创建了新型 ATX 抑制剂,即具有三点锁定结合模式的 VI 型抑制剂。新化合物 4 和 41 的 IC50达到纳摩尔级别,且结合模式独特,利用了 ATX 三方位点的多个部分。它们在细胞迁移和抑制 LPA 下游信号传导方面表现出与 IV 型抑制剂相似但更高效的活性,在大鼠血浆中也能有效抑制 LPA 的产生。然而,目前仍需进一步研究 VI 型抑制剂在生理活性方面与其他类型抑制剂的差异,以及这种新的结合模式是否能带来更好的治疗效果。总体而言,该研究为 ATX 抑制剂的开发提供了新的方向,为相关疾病的治疗提供了潜在的新策略,具有重要的理论和实践意义。