单细胞测序揭示 T - 幼淋巴细胞白血病中恶性与非恶性细胞的克隆奥秘

【字体: 时间:2025年04月22日 来源:Blood Neoplasia

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  T - 幼淋巴细胞白血病(T-PLL)治疗棘手且预后差。为探究其克隆起源与进化,研究人员对 16 例患者样本进行靶向二代测序(NGS)及单细胞分析。发现 T-PLL 克隆进化多样,非恶性 B 细胞与克隆性 T 细胞存在共享突变,为研究 T-PLL 发病机制提供新视角。

  

T - 幼淋巴细胞白血病(T-PLL)是一种源于成熟 T 细胞的侵袭性肿瘤,年发病率虽低,但却是常见的成熟 T 细胞白血病之一。患者常表现为全身疾病,治疗选择有限。多数患者对单药阿仑单抗(一种抗 CD52 抗体)初始治疗有反应,但易复发,部分患者虽可长期生存,但最终仍会发病。异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)虽能使部分患者获得持久缓解,但适用人群有限。与高侵袭性 B 细胞恶性肿瘤相比,T-PLL 预后更差。目前,针对 T-PLL 的克隆起源和进化动态的研究尚少,因此,开展相关研究对深入了解 T-PLL 的发病机制和开发新的治疗策略具有重要意义。

瑞典乌普萨拉大学医院的研究人员为了探究 T-PLL 白血病发生过程中相关基因的突变情况,进而阐明该疾病的克隆起源和进化,开展了一项研究。他们对 16 例 T-PLL 患者诊断和复发时的配对样本进行了靶向二代测序(NGS),并结合单细胞分析等技术进行研究。研究发现,T-PLL 在诊断和复发之间呈现出多种克隆进化模式;非恶性 B 细胞和克隆性 T 细胞存在共享的突变特征;还观察到 1 例患者可能存在潜在种系起源的 ATM 基因突变。这一研究为理解 T-PLL 的发病机制提供了新的视角,对未来开发更有效的治疗方法具有重要意义。该研究成果发表在《Blood Neoplasia》杂志上。


研究人员采用了多种关键技术方法。首先是样本采集与细胞分离,收集 16 例患者的骨髓抽吸物和外周血样本,通过磁珠分离等技术获取不同细胞群体。接着进行 DNA 测序,利用定制的 HaloPlex 基因面板对提取的基因组 DNA(gDNA)进行 NGS 测序。同时,运用液滴数字聚合酶链反应(ddPCR)对低变异等位基因频率的突变进行验证。最后,使用 Mission Bio Tapestri Platform 对 2 例患者样本进行单细胞 DNA 和蛋白质多组学分析。


研究结果如下:


  • 患者临床特征:16 例患者中,中位诊断年龄为 69 岁,14 例患者已故。8 例患者接受阿仑单抗治疗,部分后续进行 allo-HSCT。患者从诊断到首次治疗的平均时间为 14 个月,平均总生存期为 24 个月。

  • 基因变异情况:诊断时,最常突变的基因是 ATM(n=10),其次是 STAT5B(n=7)等。在 11 例患者中检测到 21 个致病性(P)或可能致病性(LP)变异,复发样本(n=9)中检测到 14 个 P/LP 变异。部分患者在诊断时未检测到变异。

  • 克隆进化模式:对 9 例有诊断和复发样本的患者分析发现,克隆进化模式多样。部分患者基因突变的变异等位基因频率(VAF)在复发时增加,部分降低,部分既有增加又有降低,还有患者在诊断和复发时均未检测到突变。

  • 突变验证与单细胞分析:通过 ddPCR 验证了部分患者样本中突变的存在,且与 NGS 结果一致。单细胞多组学分析显示,患者 2 的几乎所有 T 细胞中都检测到 ATM 和 STAT5B 突变;患者 6 的 B 细胞和 T 细胞中均检测到 ATM 和 EZH2 突变。


研究结论表明,T-PLL 在诊断和复发之间的克隆进化模式多样。单细胞多组学分析揭示了非恶性 B 细胞和克隆性 T 细胞存在共享的突变特征。此外,研究还发现了 1 例患者可能存在潜在种系起源的 ATM 基因突变,虽然其在 T-PLL 发病机制中的作用尚待进一步研究,但这一发现为深入理解 T-PLL 的发病机制提供了新线索。研究的局限性在于采用靶向研究方法,可能遗漏其他基因变异,且缺乏细胞遗传学数据。总体而言,该研究为 T-PLL 的研究开辟了新方向,有助于推动针对 T-PLL 的精准治疗和预防策略的发展。


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