解析 CDF1 通过植物特异性 DNA 结合域在 CONSTANS 启动子上积累的结构机制:解锁光周期开花调控密码

【字体: 时间:2025年04月23日 来源:Nature Plants 15.8

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  为探究 Dof 结构域如何仅通过结合 AAAG/CTTT 四个核苷酸识别特定启动子调控基因表达,研究人员开展了 CYCLING DOF FACTOR 1(CDF1)的 Dof 结构域与含顺式元件 DNA 复合物的晶体结构研究。结果揭示其独特锌带折叠结构,有助于调控基因表达。

  DNA 结合单指(Dof)蛋白是一类植物特异性转录因子,其特征是具有高度保守的 Dof DNA 结合结构域。众多成员在植物的各种生物学过程中发挥着关键作用。然而,Dof 结构域如何仅通过结合四个核苷酸(AAAG/CTTT)识别特定的一组启动子来调控基因表达,这一点尚不清楚。
在这里,研究人员解析了 CYCLING DOF FACTOR 1(CDF1)的 Dof 结构域与含有两个顺式元件的 DNA 形成复合物的晶体结构。CDF1 是一种研究较为深入的 Dof 蛋白,它通过结合 CONSTANS 启动子作为转录抑制因子,调控植物的光周期开花过程。
研究数据显示,Dof 结构域呈现出一种独特的锌带折叠结构,包含一个由三条链组成的反平行 β- 折叠片和一个羧基末端环。这种结构使得它在识别 DNA 时,能够定向扩大 DNA 的大沟。这些结构特征有助于它以合适的排列方式结合相邻的靶顺式元件,从而有效地调控基因表达。
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