套索肽RES-701-3结合ETB受体的冷冻电镜结构揭示GPCR反向激动机制

【字体: 时间:2025年04月23日 来源:Nature Communications 14.7

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  本研究通过冷冻电镜解析了套索肽RES-701-3与内皮素B型受体(ETB)的复合物结构,揭示了其通过疏水相互作用稳定受体非活性构象的反向激动机制。该研究为开发靶向ETB的肿瘤免疫治疗药物提供了结构基础,并拓展了套索肽在GPCR靶向药物设计中的应用前景。

  

内皮素B型受体(ETB)作为G蛋白偶联受体(GPCR)家族成员,在血管调节和肿瘤微环境调控中发挥关键作用。其过度表达会导致肿瘤免疫"冷"表型,使患者对免疫治疗产生抵抗。虽然小分子抑制剂如BQ-788已被开发,但存在选择性不足(ETB/ETA≈20倍)和半衰期短等问题。源自链霉菌的套索肽RES-701-3展现出对ETB的纳摩尔级抑制活性和超高选择性(ETB/ETA>1000倍),但其作用机制长期未知。

东京大学等机构的研究人员通过异源表达系统突破产量瓶颈,采用钙调磷酸酶(CN)融合策略成功解析了RES-701-3-ETB复合物的3.3?冷冻电镜结构。研究发现RES-701-3通过W10和F11等芳香族残基与受体跨膜区形成1078?2的相互作用界面,其独特的"环-尾"结构使C端朝向外周而疏水环深入结合口袋。更重要的是,该肽通过阻止W3366.48侧链旋转,抑制了GPCR激活必需的构象变化,首次从结构上阐明其反向激动机制。该成果发表于《Nature Communications》,为开发靶向ETB的肿瘤免疫治疗药物提供了新思路。

关键技术包括:1) 采用Streptomyces venezuelae异源表达系统实现RES-701-3毫克级产量;2) 通过CN-A/CN-B三处融合稳定GPCR构象;3) 冷冻电镜单颗粒分析技术解析复合物结构;4) TGFα脱落实验验证反向激动活性;5) 竞争结合实验测定突变体亲和力。

【RES-701-3及其类似物的生产】
研究人员在Streptomyces venezuelae中重构RES-701-3生物合成基因簇(lasA-C),产量达12 mg/L,较天然宿主提高60倍。通过定点突变获得28种变体,为结构-活性关系(SAR)研究奠定基础。

【RES-701-3药理学特性】
放射性配体结合实验证实RES-701-3对ETB的IC50为31.5 nM,且对ETA无活性。TGFα脱落实验显示其能降低ETB-L1933.43Q组成型激活突变体的基础活性(EC50=43 nM),首次明确其反向激动剂属性。药代动力学分析显示其在小鼠体内半衰期超6小时,显著优于小分子抑制剂BQ-788。

【结构解析】
采用CN融合策略克服GPCR柔性难题,通过冷冻电镜获得apo和RES-701-3结合ETB的3.3?结构。发现CN-B与受体胞内面形成711?2的静电相互作用界面,远超传统融合蛋白(如A2A-BRIL仅307?2)。

【RES-701-3结合模式】
结构显示RES-701-3的G1-D9异肽键形成9残基环,C端穿过该环形成"套索"拓扑。关键残基W3嵌入TM7的Y15疏水口袋,W10/F11与TM5/TM6相互作用。突变实验证实W3A等突变导致亲和力下降超100倍,与结构观察一致。

【反向激动机制】
与激动剂ET-1诱导的TM6内移不同,RES-701-3通过W10将W3366.48侧链向外旋转,阻止其与F3324.44相互作用,从而抑制P5.50I/V3.40F6.44基序构象变化。这种独特的"构象锁定"机制解释了其反向激动活性。

该研究首次揭示套索肽靶向人类GPCR的结构基础,阐明了RES-701-3通过"双Trp锚定"(W3和W10)实现高选择性和反向激动活性的分子机制。所开发的CN融合策略为柔性膜蛋白结构解析提供新方法。从转化医学角度看,该成果不仅为克服ETB介导的肿瘤免疫抵抗提供了精准靶向工具,更拓展了套索肽在GPCR药物开发中的应用范式,其"环-尾"拓扑结构为设计新型受体调节剂提供了创新模板。

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