《内源性蛋白的混合标记与疏水靶向：解锁未折叠蛋白反应的无偏映射新密码》

为深入探究蛋白质组的组织、调控与功能，研究人员开发新方法。通过构建内源性标记蛋白的细胞库，结合成像与原位测序，揭示了蛋白质错误折叠的细胞响应。该成果助力蛋白质组研究，为解析蛋白质质量控制机制提供关键依据。

　　

为实现对蛋白质组的组织、调控和功能进行系统层面的洞察，研究人员开发出一种方法，用于生成带有内源性标记蛋白的复杂细胞池，这些细胞池适用于高通量可视化和扰动实验。混合成像与原位条形码测序相结合，能够识别每个卤代标签（HaloTag）标记蛋白的亚细胞定位。随后，通过配体诱导文库中的蛋白错误折叠，再进行单细胞 RNA 测序，揭示了细胞对空间受限的蛋白质错误折叠的响应。这些数据集描绘了此前未被研究的细胞区室中的蛋白质质量控制反应，跨区室分析显示，细胞的反应并非协同，而是相互排斥的，即热休克反应（HSR）在某些区室中被诱导，而在另一些区室中，自噬基因被诱导，同时热休克反应被抑制。研究人员还基于细胞各区间对蛋白质错误折叠的共享转录反应，为之前未被表征的基因赋予了蛋白质质量控制功能。总之，该研究提出了一种高效的方法，用于大规模研究蛋白质组的动态变化、功能和内稳态。