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马尔堡病毒(MARV)严重威胁人类健康,且缺乏针对其 2′-O - 甲基转移酶(2′-O-MTase)的结构数据限制了药物研发。研究人员利用 AlphaFold2 预测该结构并筛选 62 种已知抑制剂,发现 4 种潜在候选药物,为 MARV 治疗提供新方向。
马尔堡病毒(MARV)对人类健康构成重大威胁,迫切需要有效的治疗方法。MARV 基因组编码一种多功能的 “大” L 蛋白,在聚合酶、加帽和甲基转移酶活性中发挥关键作用。在这种蛋白中,2′-O - 甲基转移酶(2′-O-MTase)结构域对病毒复制和免疫逃逸至关重要,是很有前景的治疗靶点。然而,该结构域缺乏结构数据,限制了药物研发。
为应对这一挑战,研究人员运用 AlphaFold2 预测 MARV 2′-O-MTase 结构域的三维结构。通过与天然配体 S - 腺苷甲硫氨酸(SAM)进行分子对接,确定了参与配体结合的关键活性位点残基。随后,研究人员针对该结构域筛选了 62 种已知抑制剂,确定了 4 种有潜力的候选药物:利法替尼(Lifirafenib,-9.5 kcal/mol)、度鲁特韦(Dolutegravir,-8.5 kcal/mol)、BRD3969(-8.3 kcal/mol)和 JFD00244(-8.2 kcal/mol) 。
研究人员进一步评估了这些化合物的药代动力学和药效学特性,以评价其成药可能性。分子动力学模拟结合分子力学广义玻恩表面积(MM/GBSA)自由能计算,证实了所选抑制剂与靶结构域之间存在稳定的相互作用。虽然这些发现为治疗 MARV 指明了有潜力的候选药物,但仍需通过体外和体内试验进行实验验证,以评估其安全性和有效性。