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本文通过高通量筛选,发现 PI3K/AKT 信号通路可激活 c-Myc,促进应激诱导的功能性淀粉样聚集体(A 体)形成。这揭示了该通路在细胞应激反应中的新功能,为研究相关疾病(如阿尔茨海默病)的发病机制提供了重要线索。
研究背景
细胞会对外界刺激做出反应,改变代谢行为,这通常通过激活信号级联来实现。生物分子凝聚物在真核细胞应激反应中扮演重要角色,其中核仁是一种特殊的凝聚物,在正常和应激条件下功能不同。当受到应激刺激时,核仁会发生结构和功能变化,形成淀粉样体(A 体)。A 体由非编码 RNA(ncRNA)招募细胞蛋白形成,与神经退行性疾病中的淀粉样斑块有相似特征,但 A 体具有保护细胞的功能,能诱导细胞进入休眠状态,增强细胞在恶劣环境下的生存能力。此前,虽已明确介导 A 体形成的 ncRNA 的作用,但 A 体生物发生信号轴的其他成分尚未确定。
研究方法
为了找到调控 A 体生物发生的上游调节因子,研究人员开发了一种基于图像的高通量筛选方法。他们用 4344 种生物活性化合物处理稳定表达 GFP 标记的 A 体靶向序列(ATS-GFP)的细胞,这些化合物作用于多种细胞途径。在热休克处理后,通过成像和评分,筛选出 147 种能显著减少 A 体聚集的化合物。之后,对部分候选化合物进行单独验证,评估其对 A 体招募的影响。
研究结果
- PI3K/AKT 信号级联促进应激诱导的 A 体形成:近一半的候选化合物靶向 PI3K/AKT 信号轴或细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)家族。研究重点关注 PI3K/AKT 信号通路,发现该通路在 A 体形成的相同温度下被激活。用抗体检测发现,在约 42 - 43°C 时,AKT 磷酸化水平升高,与 A 体形成动力学一致。用 PH (AKT)-GFP 融合报告构建体检测发现,热休克会使 PH (AKT)-GFP 重新定位到细胞表面,表明细胞膜上 PIP3 水平升高。缩短化合物预处理时间后发现,PI3K、mTOR 和 AKT1 抑制剂会损害 ATS-GFP 聚集,抑制内源性 A 体成分的招募和刚果红结合,证明这些信号抑制剂广泛破坏 A 体形成。此外,在多种细胞系和不同应激条件下验证,发现 PI3K/AKT 信号通路在 A 体形成中具有保守性。
- PI3K/AKT 信号通过抑制 GSK3α/β 调节 rIGS16RNA 表达:应激诱导的 rIGS16RNA 表达对 A 体生物发生至关重要,但此前其细胞调节因子未明确。研究发现,AKT 磷酸化先于 rIGS16RNA 表达,PI3K、mTORC1/2 和 AKT 抑制剂以及 AKT1 的 siRNA 介导的消耗都会显著降低热介导的 rIGS16RNA 诱导。通过对高通量筛选数据的分析,发现糖原合成酶激酶 3(GSK3α/β)抑制剂可增强 A 体生物发生,促进 CDC73 和 MDM2 招募,提高 rIGS16RNA 水平。PI3K/AKT 介导的 GSK3α/β 失活可促进 rIGS16RNA 表达,从而调节热休克期间 A 体的形成。
- c-Myc 在热休克期间积累在核仁中以诱导 rIGS16RNA 表达:GSK3α/β 的底物中有很多转录因子,研究人员在高通量筛选结果中发现 c-Myc 可能是相关转录因子。热休克时,c-Myc 迅速积累在核仁中,且早于 rIGS16RNA 表达。c-Myc 的 siRNA 介导的消耗会显著减少 A 体形成和 rIGS16RNA 表达。PI3K/AKT 通路抑制剂会降低 c-Myc 在细胞核 / 核仁中的水平,而 GSK3α/β 失活会导致 c-Myc 蛋白进一步积累。染色质免疫沉淀(ChIP)数据表明,c-Myc 能与 rIGS16RNA 编码区域结合,且这种结合在高温下增强,PI3K 抑制会阻碍这种结合。Max 是 c-Myc 结合 E-box 元件的关键伴侣,其消耗会产生与 c-Myc 消耗类似的结果,证明 PI3K/AKT 介导的 GSK3α/β 失活稳定 c-Myc 蛋白,增强其与 rIGS16RNA 位点的结合,上调驱动生理淀粉样聚集的 ncRNA。
研究讨论
本研究确定了 PI3K、mTORC2、AKT、GSK3、c-Myc 和 Max 等在功能性淀粉样聚集体形成中的作用,构建了驱动 A 体生物发生的细胞调节因子级联。激活 PI3K 通路通常与细胞增殖相关,但在恶劣环境下却诱导细胞休眠,这种差异的机制尚不清楚,可能存在未发现的信号成分和串扰分子。此外,目前还不清楚是哪些细胞因子感知环境变化激活 PI3K/AKT 信号通路,瞬态受体电位(TRP)通道可能是潜在的候选者。研究还发现,A 体形成和 PI3K/AKT 激活仅在热休克和缺氧 / 酸中毒等特定应激条件下发生,缺氧 / 酸中毒与中风和阿尔茨海默病相关,提示该通路与疾病可能存在联系。c-Myc 在肿瘤中既促进又抑制细胞增殖的机制也有待进一步研究,可能与 c-Myc 优先结合特定位点以及染色质可及性等因素有关。本研究揭示的 PI3K/AKT 信号通路与 A 体生物发生的关系,可能为阿尔茨海默病等神经退行性疾病的病因研究提供线索,但还需要更多研究验证。
研究局限性
本研究通过高通量筛选确定了 PI3K/AKT 信号轴在 A 体生物发生中的作用,但由于使用化合物阵列,研究局限于可被现有小分子抑制剂作用的细胞因子,可能遗漏了其他参与 A 体形成的细胞因子。目前还缺乏能特异性靶向 PI3K/AKT 通路上游激活剂的化合物,限制了对该应激诱导信号通路的进一步研究。未来可利用针对膜受体的基因敲低文库来深入了解这一现象。