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肿瘤严重威胁全球健康，为探究伴侣蛋白 TCP1 亚基 5（CCT5）在肿瘤中的作用，研究人员开展泛癌分析。结果显示，CCT5 在多数肿瘤中高表达，与预后不良相关，还和免疫细胞浸润等有关。该研究为肿瘤诊疗提供新方向。
癌症，这个如同幽灵般的存在，长期以来在全球范围内肆虐，严重威胁着人类的健康。2022 年，全球约有 2000 万新增癌症病例，近 1000 万人因癌症离世，亚洲更是占据了近一半的新发病例。在探索癌症奥秘的道路上，寻找关键的生物标志物和有效的治疗靶点，成为了科研人员们攻克癌症的关键所在。
伴侣蛋白 TCP1 亚基 5（CCT5），作为细胞内的 “分子伴侣”，在蛋白质折叠过程中发挥着重要作用，其与癌症的关联也逐渐引起了科学家们的关注。此前，虽然有研究暗示 CCT5 可能参与肿瘤的发生发展，但一直缺乏系统全面的泛癌分析。为了填补这一空白，来自孟加拉国健康创新、研究、行动与学习中心（Center for Health Innovation, Research, Action, and Learning-Bangladesh，CHIRAL Bangladesh）等机构的研究人员，踏上了探索 CCT5 在肿瘤中奥秘的征程。
研究人员整合了多个权威数据库，如 TCGA、TIMER2.0、GEPIA2 等，对 33 种不同肿瘤进行了深入研究。他们从基因表达、蛋白质组学、免疫浸润、DNA 甲基化、基因改变等多个层面入手，全面剖析 CCT5 在肿瘤中的角色。研究发现，CCT5 在多数肿瘤中呈现高表达状态，并且与患者的总生存期（OS）和无病生存期（DFS）密切相关，高表达的 CCT5 往往预示着患者预后不良。在 DNA 甲基化方面，肿瘤组织中 CCT5 的启动子和 N - 岸甲基化水平降低，这表明 CCT5 可能通过表观遗传机制促进肿瘤的发展。基因改变分析显示，CCT5 的扩增是其在肿瘤中常见的改变类型，且在不同肿瘤类型中突变频率存在差异。免疫浸润分析发现，CCT5 与多种免疫细胞的浸润密切相关，如癌症相关成纤维细胞（CAFs）、CD8+ T 细胞和 NK 细胞等，这意味着 CCT5 可能在肿瘤的免疫微环境中发挥着重要作用。此外，CCT5 的表达还与肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI）存在显著相关性，在肾透明细胞癌（KIRC）和胃腺癌（STAD）中尤为明显。
该研究成果发表在《Scientific Reports》上，为肿瘤的研究和治疗开辟了新的方向。CCT5 有望成为多种癌症的潜在预后生物标志物和免疫治疗靶点，这对于提高癌症的诊断准确性和治疗效果具有重要意义。
研究人员主要采用了以下关键技术方法：利用 TCGA 数据库获取肿瘤样本数据；借助 TIMER2.0 和 GEPIA2 等数据库进行基因表达分析；通过 UALCAN 数据库开展蛋白质组学和 DNA 甲基化分析；运用 cBioPortal 数据库进行基因改变分析；使用 TCGAplot R 包分析 CCT5 与 TMB、MSI 的相关性；利用 TISCH2 数据库进行单细胞功能分析；借助 GSCA 数据库分析药物敏感性；通过 STRING 和 GEPIA2 进行基因富集分析。
1. 表达水平：研究人员利用 TIMER2.0、GEPIA2 和 UALCAN 数据库分析发现，CCT5 在多种肿瘤细胞中表达显著高于正常组织，如膀胱癌（BLCA）、乳腺癌（BRCA）等；但在某些肿瘤中表达下调，如肾嫌色细胞癌（KICH）、皮肤黑色素瘤（SKCM）等。并且，在部分肿瘤中，CCT5 的表达与肿瘤分期相关。
2. 蛋白质组学分析：通过 UALCAN 数据库分析不同肿瘤和正常组织中 CCT5 的蛋白质表达，发现其在卵巢癌、结肠癌等肿瘤中表达较高，在乳腺癌、胰腺癌等肿瘤中表达较低。
3. 生存分析：利用 GEPIA2 进行生存分析，结果显示高表达的 CCT5 与多种肿瘤患者的不良预后相关，如肾上腺皮质癌（ACC）、乳腺癌（BRCA）等的总生存期缩短，膀胱癌（BLCA）、肾乳头状细胞癌（KIRP）等的无病生存期缩短。
4. 甲基化分析：运用 UALCAN 和 SMART 数据库分析发现，CCT5 的启动子甲基化水平在多种肿瘤中下调，N - 岸探针 cg17315844 在多数恶性肿瘤中的甲基化水平低于健康组织。
5. 基因改变分析：借助 cBioPortal 数据库，研究人员发现 CCT5 基因改变在肺鳞癌（LUSC）中频率较高，主要改变类型为扩增。此外，在皮肤黑色素瘤（SKCM）患者中，CCT5 突变与较好的无进展生存期相关。
6. 免疫浸润分析：使用 TIMER2 的 EPIC 算法分析表明，CCT5 表达与多种肿瘤中癌症相关成纤维细胞（CAFs）、CD8+ T 细胞和 NK 细胞的浸润存在相关性，且与部分肿瘤的预后相关。
7. CCT5 表达与 TMB 和 MSI 的相关性：通过 Pearson 相关分析发现，CCT5 表达与多种癌症的 TMB 和 MSI 存在显著相关性，在 KIRC 和 STAD 中，CCT5 与两者均呈正相关。
8. 泛癌中 CCT5 与免疫微环境的相关性：利用 TCGAplot R 包分析发现，CCT5 与免疫评分、多种免疫细胞和免疫检查点相关基因存在相关性，且在不同肿瘤中的相关性不同。
9. 单细胞功能分析：借助 TISCH2 数据库，研究人员发现 CCT5 在免疫细胞中的表达高于基质细胞，如在增殖性 T 细胞（Tprolif）、常规 CD4 T 细胞（CD4Tconv）等免疫细胞中高表达。
10. 药物敏感性分析：通过 GSCA 数据库分析发现，CCT5 表达与多种药物的敏感性相关，如与 XMD8 - 85、Selumetinib 等药物呈正相关，与依托泊苷（Etoposide）和丝裂霉素 C（Mitomycin C）呈负相关。
11. 基因富集分析：利用 STRING 和 GEPIA2 获取 CCT5 的结合蛋白和共表达基因，通过 Enrichr 数据库进行富集分析，结果显示 CCT5 与细胞周期通路、蛋白质稳定等多种分子功能和信号通路相关。
研究结论表明，CCT5 在多种癌症中广泛高表达，其表达和基因改变与临床结局显著相关，可作为潜在的预后生物标志物。同时，CCT5 可能通过表观遗传机制发挥致癌作用，并且与免疫细胞浸润密切相关，在肿瘤免疫微环境中具有重要意义。此外，CCT5 表达与多种药物敏感性相关，为开发靶向免疫治疗提供了潜在方向。然而，该研究也存在一定的局限性，如数据库数据处理方法不一致可能引入偏差，部分罕见肿瘤样本量有限，且仅通过生物信息学方法研究，后续还需进一步的体内外实验验证。尽管如此，这项研究为肿瘤领域的研究提供了重要的理论基础和新的研究方向，有望推动肿瘤诊疗技术的进一步发展。
