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为探究小麦(Triticum aestivum L.)株高和小穗密度性状的遗传机制,研究人员对小麦突变体 dsc 展开研究。发现 dsc 表型由单显性基因控制,定位到 5AL 染色体上的 5AQ 基因是突变基因,其 miR172 结合位点突变影响表达,或为产量育种提供新途径。
株高和小穗密度是影响小麦(Triticum aestivum L.)产量的两个重要性状。此前,研究人员从经甲基磺酸乙酯处理的小麦品种国麦 301(野生型,WT)中获得了一个名为矮秆密穗(dsc)的突变体。本研究对 dsc 突变体的遗传规律、突变基因定位及候选基因进行了探究。
高分辨率染色体涂染分析显示,dsc 突变体没有可见的结构变异。遗传分析表明,dsc 的表型由一个单显性基因控制,命名为 dsc。研究人员利用小麦 660K 单核苷酸多态性(SNP)芯片和简单序列重复(SSR)标记技术对突变基因进行定位。在 DNA 混合池中共鉴定出 984 个 SNP,其中 492 个位于 5A 染色体 580 - 680Mb 的基因组区域,占总数的 50%。dsc 基因被定位在 5AL 染色体臂上一个 33.4Mb(625.7 - 659.1Mb)的区域内,两侧是 SSR 标记 Xbarc319 和 Xgpw2136,该区域存在 5AQ 基因。
研究人员比较了野生型和 dsc 突变体中 5AQ 基因的序列和表达模式,发现二者在 miR172 结合位点存在一个单核苷酸多态性(SNP,G > A)。基于此 SNP 开发了一个衍生型酶切扩增多态性序列(dCAPS)标记,该标记在 dsc 与中国春(CS)杂交得到的 F2:3群体中与突变表型共分离,这表明 5AQ 基因就是 dsc 突变体的突变基因。
进一步研究发现,5AQ 基因在 dsc 突变体的根、茎、叶和穗中的表达水平显著高于野生型。研究结果表明,5AQ 基因 miR172 结合位点的点突变可能通过减少依赖 miRNA 的降解作用,提高了其转录水平,进而对小穗密度和株高产生多效性影响。显然,miR172 - Q 是调控小麦生长和穗发育的关键模块。这个 dCAPS 标记可用于小麦育种中检测 Q 基因的优良等位基因,调控 miR172 - Q 模块或许会成为小麦产量育种的一种新方法。