实时与离线叠层成像重建质量相当,为科研带来新突破

【字体: 时间:2025年04月27日 来源:Scientific Reports 3.8

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  叠层成像技术(Ptychography)在多领域意义重大,但其传统离线重建耗时久。研究人员对比实时与离线重建质量,发现二者在不同重叠条件下差异可忽略不计。这表明实时重建有望替代或补充离线重建,提升科研效率。

  在科学研究的微观世界探索中,叠层成像技术(Ptychography)宛如一把神奇的钥匙,为人们打开了高分辨率、无透镜的复杂样本成像大门。这项技术凭借分析重叠的衍射图案,能够实现对样本的精细重构,在材料科学、生物学和纳米技术等诸多前沿领域发挥着不可替代的作用。然而,传统的叠层成像重建方式是在扫描完成后才启动,漫长的处理时间就像一道屏障,严重阻碍了实验反馈的及时性,使得研究人员无法及时对实验设置和扫描质量做出调整。特别是随着探测器和光源技术的飞速发展,数据采集速度大幅提升,这种延迟问题愈发凸显,仿佛在科研的高速公路上设置了减速带,限制了研究的进程。
为了突破这一困境,来自瑞典乌普萨拉大学(Uppsala University)细胞与分子生物学系分子生物物理实验室、隆德大学(Lund University)MAX IV 实验室以及美国劳伦斯伯克利国家实验室(Lawrence Berkeley National Laboratory)NERSC 的研究人员 Rebecka Lexelius、Maik Kahnt 和 Filipe R. N. C. Maia 开展了一项极具价值的研究。他们聚焦于实时与离线叠层成像重建质量的对比,试图揭开实时重建是否能媲美离线重建的神秘面纱。最终,研究成果发表在《Scientific Reports》上,为该领域带来了重要的突破。

研究人员在研究过程中运用了多种关键技术方法。首先,通过模拟样本和衍射图案,利用已知的复杂折射率数据构建样本模型,并结合实验测定的探针进行模拟。在模拟过程中,使用 PtyPy 软件生成带有泊松噪声的衍射图案,模拟真实实验情况。其次,采用自定义的 PtyPy 版本进行叠层成像重建,分别设置离线和实时重建的参数,在实时重建中按照特定时间间隔和数据块加载数据进行迭代计算。最后,运用多种数据分析方法,如裁剪图像、去除相位斜坡、计算相对位移、转换光学密度以及计算归一化均方误差(NMSE)等,对重建结果进行精确评估 。

研究结果


  1. 重建质量对比:研究人员详细对比了基于不同重叠条件下的离线和实时重建结果。通过计算光学密度(OD)差异、相位差异以及归一化均方误差(NMSE),发现离线和实时重建在误差指标上并无实质性差异。无论是高重叠(90.0%)还是低重叠(54.2%)的情况,两种重建方式与真实样本之间的误差相近,且二者之间的差异始终小于与真实样本的差异123
  2. 迭代过程分析:在重建的迭代过程中,研究人员观察到离线和实时重建的 NMSE 随着迭代次数的增加迅速收敛到相似的值。这意味着在重建的各个阶段,实时重建都能够保持与离线重建相当的准确性,不会因为实时处理数据的特性而导致重建质量下降2

研究结论与讨论


这项研究明确证实,在测试的重叠率范围内,实时叠层成像重建完全可以作为离线重建的有效替代方法,且不会牺牲图像质量。这一发现意义非凡,它打破了传统观念中对实时重建质量的疑虑,为科研工作流程带来了革新的可能。在实际的实验场景中,研究人员能够依据实时重建的结果,在实验进行过程中及时调整扫描步长、曝光时间等关键参数,实现实验条件的动态优化,既提高了数据质量,又减少了不必要的数据存储需求。同时,实时重建避免了实验后的离线处理环节,大大加快了科研成果的产出速度,让研究人员能够更快地将研究成果应用于实际,推动相关领域的快速发展。

尽管本研究是基于模拟样本展开,但研究人员认为其结果与真实实验结果高度相似。不过,研究也指出,除了重叠率之外,还有诸多因素,如加载新帧之间的迭代分布、加载帧的数据块大小以及处理部分相干性所使用的探针模式数量等,可能会对实时重建性能产生影响,这些将是未来研究需要深入探索的方向。

总体而言,这项研究为叠层成像技术的发展注入了新的活力,为众多依赖该技术的科研领域开辟了更高效、更精准的研究路径,为微观世界的探索提供了更有力的工具。

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