探秘白蚁肠道微生物组:两种 GH10 酶助力高粱秸秆高值化利用

【字体: 时间:2025年04月29日 来源:Applied Microbiology and Biotechnology 3.9

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  为解决木质纤维素生物质利用成本高及挖掘新型酶的问题,研究人员对来自白蚁肠道微生物组的两种 GH10 酶(Xyl10 C 和 Xyl10E)进行研究。结果显示,它们能水解预处理高粱秸秆,产物有抗氧化活性。这为农业废弃物利用提供了新途径。

  

在地球的生物宝库中,木质纤维素是最为丰富且可再生的碳源,它主要由纤维素、半纤维素和木质素组成。然而,植物来源的木质纤维素生物质,因其复杂的聚合物组成,如同坚固的堡垒,阻碍了对其多糖中糖分成分的高效利用。为了攻克这一难题,人们通常在酶解前对其进行物理、化学或生物预处理,其中碱性化学预处理虽常用,但成本高昂,成为大规模商业化的绊脚石。

在寻找可持续生物质资源的道路上,甜高粱(Sorghum bicolor)秸秆进入了研究人员的视野。它是甜高粱茎汁提取后的剩余物,约占植株的 36% 。而且,甜高粱凭借其高光合速率、丰富遗传多样性和耐旱性,在生物燃料生产和高附加值生物分子来源方面极具潜力。


与此同时,酶在推动传统化学工业向绿色可持续方向发展中扮演着关键角色。木聚糖酶(Xylanases,EC 3.2.1.8)可催化木聚糖(半纤维素中最丰富的多糖)内部 1,4-β-D 木糖苷键的水解;β - 葡聚糖酶(β -glucanases)能将 β - 葡聚糖水解为纤维寡糖(COs)和葡萄糖。这些酶在多个行业都有广泛应用,如木聚糖酶用于造纸、生物乙醇生产等,β - 葡聚糖酶则在饲料、食品和纺织业发挥重要作用。


复杂微生物群落的数据密集型宏基因组方法,为寻找和鉴定新型酶提供了有力工具。白蚁肠道作为一个特殊环境,具有独特的 pH、氧气和底物梯度,类似工业环境,且其中多数微生物难以培养,使得宏基因组研究成为筛选特殊酶的理想选择。


基于此,来自阿根廷和意大利等科研机构的研究人员,开展了一项旨在深入探究白蚁肠道微生物组中潜在木聚糖酶的研究。他们从白蚁肠道微生物组中筛选并鉴定了两种新型糖苷水解酶家族 10(GH10)的酶 ——Xyl10 C 和 Xyl10E,研究成果发表在《Applied Microbiology and Biotechnology 》上。


研究人员运用了多种关键技术方法。首先,通过生物信息学分析从白蚁肠道宏基因组中筛选出编码 Xyl10 C 和 Xyl10E 的基因。接着,采用克隆、表达和蛋白纯化技术获得重组蛋白。之后,利用生化分析方法,测定酶在不同底物上的活性、最适 pH 和温度、热稳定性等特性,并借助薄层层析(TLC)和高效阴离子交换色谱(HPAEC-PAD)分析水解产物。此外,还运用分子分析技术对酶的结构进行研究。


研究结果


  1. 预处理高粱秸秆的化学组成:预处理后的高粱秸秆(SBB)主要由木糖、阿拉伯糖、半乳糖和葡萄糖组成,其中木糖含量最高。通过多种分析技术确定了其单体比例和多糖结构特征。

  2. Xyl10 C 和 Xyl10E 的序列与系统发育分析:BLASTP 分析显示,Xyl10 C 和 Xyl10E 与来自 Treponema sp. 的内切 β -1,4 - 木聚糖酶相似度较高。多序列比对发现,它们在 GH10 家族的催化区域高度保守。系统发育分析表明,这两种酶与来自白蚁肠道微生物组的木聚糖酶聚类在一起。

  3. Xyl10 C 和 Xyl10E 的克隆与异源表达:成功克隆并表达了 Xyl10 C 和 Xyl10E,获得的重组蛋白分子量与预期相符,为后续研究提供了物质基础。

  4. 重组酶的活性表征:Xyl10 C 和 Xyl10E 对山毛榉木聚糖和预处理 SBB 均有活性,Xyl10E 还对大麦 β - 葡聚糖有活性。Xyl10 C 在 pH 7.0 - 8.0、50 - 60°C 时木聚糖酶活性最佳;Xyl10E 的活性 pH 范围更宽(5.0 - 10.0),最适温度为 50°C。二者在 40°C 孵育 8 h 后,仍分别保留 85% 和 70% 的木聚糖酶活性。Xyl10 C 在高盐浓度下活性增加,表现出耐盐性。

  5. 水解产物分析:TLC 和 HPLC 分析表明,Xyl10 C 和 Xyl10E 水解山毛榉木聚糖和预处理 SBB 的主要产物是木二糖(X2),还有少量木糖(X1)、木三糖(X3)和木四糖(X4)。Xyl10E 水解预处理 SBB 时,6 h 时 X2 释放量最高。

  6. 木寡糖的抗氧化活性:Xyl10E 水解预处理 SBB 产生的木寡糖(XOs)具有浓度依赖性的抗氧化活性,在 DPPH 和 ABTS 自由基清除实验中均得到验证。

  7. Xyl10 C 和 Xyl10E 的结构分析:分子结构分析显示,两种酶都具有 GH10 家族典型的 (β/α)8TIM 桶状结构。Xyl10E 的催化口袋更大,与双功能特性相关。二者与配体的相互作用存在差异,与纤维六糖配体的相互作用比与木七糖配体的相互作用差异更大。


研究结论与讨论


本研究对预处理 SBB 的组成以及 Xyl10 C、Xyl10E 及其组合的酶活性进行了全面表征。这两种酶来自白蚁肠道微生物组,与 Treponema sp. 的内切 β -1,4 - 木聚糖酶高度相似,在进化上适应复杂的木质纤维素底物。


Xyl10 C 对木聚糖具有高底物特异性,Xyl10E 则具有双功能性,能作用于大麦 β - 葡聚糖,这是首次报道来自白蚁肠道微生物组的 GH10 双功能木聚糖酶 /β - 葡聚糖酶。尽管二者氨基酸同源性高,但酶学特性不同,Xyl10E 的双功能性与其结构特征有关,如更宽的催化口袋和特定氨基酸残基。


在工业应用方面,Xyl10 C 的耐盐性使其在海鲜加工等行业具有应用潜力;Xyl10E 可用于酿造工业降低醪液粘度。两种酶水解预处理 SBB 产生的 XOs 具有抗氧化活性,且 X2 含量较高,在食品、医药等领域有潜在应用价值。


总之,该研究揭示了 Xyl10 C 和 Xyl10E 在 SBB 增值利用中的生物技术相关性,为可持续工业应用提供了新的酶资源,也为进一步探索白蚁肠道来源的酶奠定了基础。


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