新发现!杭州竹林土壤中分离出杭州弗拉特氏菌(Frateuria hangzhouensis sp. nov.),开拓微生物研究新视野
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时间:2025年04月29日
来源:Current Microbiology 2.3
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研究人员从中国杭州毛竹(Phyllostachys edulis)林土壤中分离出菌株 STR12T。经研究发现它是革兰氏阴性菌等特性,基因组信息也已明确。这一发现为微生物分类增添新物种,拓展了对微生物多样性的认知。
从中国杭州毛竹(Phyllostachys edulis)林土壤中分离出一株新细菌,命名为 STR12T。该菌株为革兰氏阴性(Gram-stain-negative)、杆状、可运动细菌。在 28°C 培养 3 天后,菌落呈黄色、圆形、扁平、粘性、不湿润且边缘光滑。此菌株生长温度范围为 15 - 37°C(最适 28°C),pH 值范围 4.0 - 8.0(最适 pH 7.0),盐度范围 0 - 5%(w/v)NaCl(最适 1%)。基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析显示,该菌株属于弗拉特氏菌属(Frateuria),与黄色弗拉特氏菌(Frateuria flava)MAH-13T相似度最高(97.7%)。STR12T菌株基因组长度为 3.74 Mb,G+C 含量为 67.9%。与弗拉特氏菌属内其他物种的基因组比较表明,其平均核苷酸同一性(average nucleotide identity)、DNA - DNA 杂交(DNA–DNA hybridization)和平均氨基酸同一性(average amino acid identity)值范围分别为 73.9 - 85.9%、20.8 - 30.7% 和 62.7 - 86.7%,均低于原核生物物种界定阈值。STR12T菌株的主要醌类为泛醌 - 8(ubiquinone-8),主要脂肪酸为异 - C15:0、异 - C16:0、异 - C17:0和特征总和 9(Summed Feature 9)。极性脂质包括双磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol)、磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine)、两种未鉴定的氨基磷脂和一种未鉴定的磷酸糖脂。基于系统发育、生理和化学分类学分析结果,提议将该新物种命名为杭州弗拉特氏菌(Frateuria hangzhouensis sp. nov.),模式菌株为 STR12T(= ACCC 61897T = GDMCC 1.2964T = JCM 35226T)。
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