城市与乡村环境中普通仓鼠(Cricetus cricetus)不同谱系MHC-DRB基因遗传多样性比较及保护意义

为解决普通仓鼠种群锐减导致的遗传多样性下降问题，研究人员通过Illumina平台扩增子测序技术，对来自东部谱系("欧洲""高加索""阿尔泰")及西部谱系("潘诺尼亚""北部")的DRB基因外显子2等位基因多样性进行分析。研究发现东部谱系等位基因多样性是西部的3倍，其中"欧洲"谱系最具多样性，而城市克里米亚种群表现出独特的抗原结合区正选择特征，为物种保护规划提供重要依据。

　　

普通仓鼠(Cricetus cricetus)作为IUCN红色名录中种群数量锐减的物种，却在自然栖息地普遍衰退的背景下展现出向城市扩张的独特适应性。这种生存策略的转变引发重要科学问题：种群萎缩是否导致主要组织相容性复合体(MHC)关键基因——DRB外显子2的遗传多样性丧失？

研究团队采用Illumina高通量测序技术，系统比较了东部谱系("Europe"、"Caucasus"、"Altai")与西部谱系("Pannonia"、"North")的DRB基因变异特征。令人惊讶的是，东部群体展现出3倍于西部群体的等位基因多样性，其中"Europe"谱系凭借独特的氨基酸序列变异和特有等位基因成为遗传"热区"，而"Caucasus"群体则呈现最低多样性。

更具启示性的发现来自克里米亚城市种群：这些隶属于"Europe"谱系的都市仓鼠不仅携带最丰富的DRB等位基因库，其抗原结合位点(antigen-binding site)更检测到显著的正选择信号——这种适应性进化机制在乡村种群中完全缺失。该现象暗示城市环境可能通过病原体选择压力，驱动MHC基因的快速进化。

这些发现为理解物种濒危与城市适应间的遗传博弈提供了新视角：东部谱系尤其是"Europe"群体储存着关键遗传资源，而城市种群可能正在进化出独特的免疫防御策略。研究数据可直接应用于保护实践，例如优先保护高多样性种群、建立遗传走廊等，为这个濒危物种的存续规划科学蓝图。