结核病灶干酪样物质宏基因组分析：揭示菌群奥秘，助力结核病精准诊疗

为探究肺结核病灶干酪样坏死中微生物群落特征，研究人员对 13 名患者的 14 个结核瘤进行鸟枪法宏基因组测序。结果显示，多数结核瘤含多微生物群落，补充或替代了原始分枝杆菌菌群。该研究为结核病治疗提供新视角。

　　肺部深处区域的微生物群与上呼吸道的微生物群存在显著差异，其生物量和动态多样性要低得多。在先前的研究中发现，与完整的肺组织相比，结核病灶卫星微生物群的生物多样性急剧下降。这些发现使得可以将结核瘤干酪样坏死中的微生物群落分为两种类型：（i）分枝杆菌干酪瘤（结核瘤），其中 70% 及以上的基因组与结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）相对应；（ii）多微生物群落，其中结核分枝杆菌的浓度在 0 到 10% 之间变化。研究人员利用鸟枪法宏基因组测序（shotgun metagenomic sequencing），在 NextSeq 550 平台（Illumina）上对来自 13 名患者的 14 个结核瘤进行了分析。使用 Kraken 2 对短读长进行分类学分类。结果表明，平均而言，99.95% 的短读长属于人类 DNA 或未分类。然而，与细菌基因组相关的已分类读长证实了这样一个观点，即在许多情况下，结核瘤含有多微生物群落，这些群落要么取代要么补充了干酪样物质中原始的分枝杆菌微生物群。