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整合酶在合成生物学中用于基因组工程等,但基于整合酶的细胞间 DNA 传递及调控研究不足。研究人员开展基于整合酶的细菌结合细胞间 DNA 传递研究,建立分层框架等,推动了相关领域发展,为合成生物学开拓新方向。
整合酶(Integrase)在合成生物学中已被广泛应用于基因组工程和遗传电路设计。它在体内介导 DNA 重组,改变单细胞系的基因型,这些变化会通过垂直基因转移被永久记录和遗传。然而,基于整合酶的细胞间 DNA 传递及其通过水平基因转移的调控,仍有待深入探索。
在此,研究人员引入了一种通用策略,用于设计、构建和测试基于整合酶的通过细菌结合(bacterial conjugation)实现的细胞间 DNA 传递。首先,他们筛选了用于高效结合的结合性质粒和受体细胞。然后,建立了分层框架来描述分层大肠杆菌(E. coli)菌株之间的相互作用,并构建双层布尔逻辑门(Boolean logic gates),以此展示细胞间 DNA 传递和调控。最后,将设计扩展到包含四层单处理途径和双层多处理系统。这一策略促进了细胞间 DNA 传递、分层信号处理,以及整合酶在系统生物学和合成生物学中的应用。