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慢性肾脏病(CKD)发病率随人口老龄化上升,且与全身衰老相关,但其潜在机制不明。研究人员聚焦近端肾小管上皮细胞(PTEC)的 DNA 损伤展开研究。结果发现 PTEC 的 DNA 损伤会致全身代谢紊乱,该发现揭示了肾 - 血 - 代谢轴,为相关疾病治疗提供方向。
在人体这个精妙复杂的 “小宇宙” 里,肾脏就像一台至关重要的 “净化工厂”,日以继夜地为身体过滤、清洁血液。可随着年龄增长,这台 “工厂” 却容易出现各种问题,其中慢性肾脏病(CKD)的发病率在全球范围内正逐渐攀升。CKD 不仅会增加肾衰竭和心血管疾病的风险,还和全身衰老有着千丝万缕的联系。然而,就像被迷雾笼罩一般,人们并不清楚这背后的具体机制。
为了揭开这层神秘的面纱,来自日本庆应义塾大学医学院等机构的研究人员踏上了探索之旅。他们将研究重点聚焦在近端肾小管上皮细胞(PTEC)的 DNA 损伤上,试图弄清楚这一小小的细胞变化,是如何在身体里掀起 “惊涛骇浪” 的。经过一系列深入研究,他们发现 PTEC 中的 DNA 损伤就像一个 “导火索”,会引发全身性的代谢紊乱,这一发现意义重大,为理解肾脏疾病与全身代谢的关系打开了新的窗口,相关研究成果发表在《Nature Communications》杂志上。
研究人员主要运用了以下几种关键技术方法:首先,构建了 PTEC 特异性表达 I-PpoI 的小鼠模型,以此来诱导 PTEC 发生 DNA 双链断裂(DSBs);其次,利用单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)技术,深入分析细胞群体的变化;此外,代谢组学分析帮助研究人员了解肾脏和肝脏的代谢改变;同时,还采用了 DNA 甲基化分析技术,探究外周血细胞 DNA 甲基化的变化情况。
下面来详细看看研究结果:
- PTEC 持续 DNA 损伤引发全身代谢变化:研究人员构建的 I-PpoI 小鼠中,PTEC 出现 DNA DSBs,但其他组织未出现。16 周龄时,I-PpoI 小鼠肾脏出现损伤迹象,如 KIM-1 和 NGAL 表达升高。同时,小鼠体重下降,脂肪量减少,肝脏脂肪增加,葡萄糖耐量受损,能量代谢也出现异常,且肾脏、肝脏和脂肪组织中的炎症和衰老标记物升高。这表明 PTEC 的 DNA 损伤会导致全身代谢改变,且伴有炎症和衰老标记物的升高。
- PTEC 的 DNA 损伤改变肾脏和肝脏的葡萄糖和脂质代谢:通过对 16 周龄 I-PpoI 小鼠肾脏和肝脏的代谢组学分析发现,其具有高无氧糖酵解和低三羧酸(TCA)循环活性的特征。肾脏中糖酵解关键酶表达增加,肝脏中糖异生酶表达增加,且 TCA 循环相关代谢物减少,支链氨基酸(BCAAs)增加。这意味着 I-PpoI 小鼠脂肪酸代谢受损,无法满足能量需求,从而导致代谢重编程和关键代谢物的改变。
- PTEC 的 DNA 损伤导致培养的肾小管细胞线粒体功能障碍:在体外实验中,过表达 I-PpoI 的培养 PTECs 表现出氧化呼吸率(OCR)和 ATP 生成减少,脂肪酸氧化(FAO)能力降低,线粒体 DNA 拷贝数减少,电子传递链复合物活性下降。这充分说明 I-PpoI 诱导的 DNA 损伤会破坏肝细胞和 PTECs 的线粒体呼吸能力,进而导致代谢重编程。
- PTEC 的 DNA 损伤激活并促进肾皮质中 CD11c 和 Ccr2 巨噬细胞的增殖:对 16 周龄 I-PpoI 小鼠肾皮质进行 scRNA-seq 分析,发现 PTECs 比例减少,Ccr2hiCD11c+巨噬细胞和炎性 Ly6ChiCcr2r单核细胞数量增加。免疫组化染色和流式细胞术分析也证实了这一结果,且 I-PpoI 小鼠脂肪组织巨噬细胞(ATM)的基因表达谱与肥胖小鼠不同。这表明 PTEC DNA 损伤会激活巨噬细胞和单核细胞,改变全身免疫环境。
- I-PpoI 小鼠中 KLF9 结合基序的 DNA 甲基化降低:对 I-PpoI 小鼠外周血细胞的 DNA 甲基化分析显示,存在 5488 个显著差异甲基化区域(DMR),在低甲基化 DMR 中鉴定出 Krüppel 样因子 9(KLF9)结合基序,其靶基因 Gasdermin D(GSDMD)低甲基化。这说明 PTEC 的 DNA 损伤会引起外周血细胞中与巨噬细胞激活相关的 DNA 甲基化改变。
- 培养的 PTEC 的 DNA 损伤通过激活的巨噬细胞改变脂肪细胞表型:体外实验表明,DNA 损伤的 PTECs 释放的高迁移率族蛋白 B1(HMGB1)等损伤相关分子模式(DAMPs)可激活巨噬细胞,诱导其焦亡,并分泌炎性细胞因子,从而损害脂肪细胞的分化和功能。
- 巨噬细胞耗竭恢复 I-PpoI 小鼠的代谢改变:给 12 周龄 I-PpoI 小鼠注射氯膦酸盐脂质体耗竭巨噬细胞后,发现小鼠的代谢异常得到改善,如血糖耐受性恢复,肝脏和内脏脂肪组织中的炎症因子表达降低。这突出了激活的巨噬细胞在 I-PpoI 小鼠代谢改变中的重要作用。
- PTEC 中 DNA DSBs 的促进与人类外周血中 CD11b 和 CD11c 细胞数量增加以及 GSDMD 的 DNA 甲基化降低有关:对人类样本的研究发现,PTEC DNA DSBs 水平与 CD11b+和 CD11c+细胞面积呈正相关,且 GSDMD 启动子区域的 DNA 甲基化与 PTEC DNA 损伤程度呈负相关,还与肝脂肪变指数(HSI)相关。这表明 CKD 患者中 PTEC DNA 损伤可能通过激活巨噬细胞,改变 DNA 甲基化,从而导致胰岛素抵抗和肝脂肪变。
综合研究结论和讨论部分,此次研究详细阐述了 PTEC 中持续的非致突变性 DNA 损伤对全身代谢的影响,揭示了肾脏细胞 DNA 损伤通过巨噬细胞激活和 DNA 甲基化改变,影响全身代谢平衡的机制。这不仅加深了人们对肾脏疾病与全身代谢关系的理解,还为治疗与 PTEC DNA 损伤相关的代谢紊乱提供了潜在的治疗靶点,有望为慢性肾脏病患者的治疗和健康管理带来新的希望 。