哥伦比亚海石竹中发现新型正番茄斑萎病毒(Orthotospovirus)全基因组测序及系统进化分析

来自荷兰的研究人员通过高通量测序技术(HTS)鉴定出哥伦比亚海石竹(Limonium sinuatum)中新型正番茄斑萎病毒(LOV1)，其核衣壳蛋白(N)氨基酸同源性<64%，系统进化归入"美洲分支"，为植物病毒分类及作物病害防控提供新依据。

　　

科研人员报道了在哥伦比亚海石竹(Limonium sinuatum)中发现的一种新型正番茄斑萎病毒(Orthotospovirus)全基因组序列，暂命名为海石竹正番茄斑萎病毒1号(LOV1)。该病毒核衣壳蛋白(N)与其他正番茄斑萎病毒成员的氨基酸相似性不足64%，远低于该属90%的物种划分阈值。

通过机械接种实验，该病毒能在本氏烟(Nicotiana benthamiana)上诱发典型症状，包括系统性坏死斑点和生长停滞。研究团队采用Illumina NovaSeq6000平台进行高通量测序(HTS)，获得病毒三个基因组片段：L片段(8839 nt)编码RNA依赖的RNA聚合酶(L)，M片段(4755 nt)编码非结构蛋白(NSm)和糖蛋白前体(GP)，S片段(2975 nt)编码非结构蛋白(NSs)和核衣壳蛋白(N)。

系统进化分析显示，LOV1的N蛋白序列与菊花茎坏死病毒(CSNV)相似性最高(63%)，属于正番茄斑萎病毒"美洲分支"。研究特别指出，病毒基因组末端存在典型的反向重复序列特征，证实测序完整性。由于研究材料为转接宿主，原始寄主是否存在其他共感染病毒尚待确认，该病毒的传播媒介蓟马种类及其农业经济影响仍需进一步研究。