菠菜抽薹的基因组奥秘:开花时间基因的比较系统发育解析

【字体: 时间:2025年04月30日 来源:Genetic Resources and Crop Evolution 1.6

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  菠菜生产面临抽薹及过早开花难题。研究人员选取 10 份菠菜种质,分析 MADS-box、COL14、FLC 基因区域。研究发现相关基因受平衡选择等,FLC 和 COL14 转换率高,还明确了遗传分组等。该研究增进对菠菜抽薹遗传调控的理解。

  菠菜是一种在全球广泛种植的叶菜类蔬菜,然而其生产过程面临着显著挑战,尤其是抽薹(bolting)现象,也就是过早地开始开花。因此,本研究旨在通过 Tajima’s D 检验、转换与颠换比率分析、主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)以及系统发育分析,深入探究菠菜抽薹的基因组奥秘。研究人员挑选了 10 份菠菜种质材料,其中包含早抽薹和晚抽薹的品种,对 MADS-box(启动子和编码区)、CONSTANS-LIKE 14(COL14)以及 FLOWERING LOCUS C(FLC)基因的编码区展开分析。这些基因呈现出的 Tajima’s D 正值,暗示着平衡选择、种群分化或者近期种群扩张等情况,这表明遗传多样性带来了适应性优势。转换与颠换比率分析揭示出存在差异,FLCCOL14展现出较高的转换比率。主成分分析能够区分早抽薹和晚抽薹基因型之间的遗传分组。系统发育分析则揭示了历史遗传关系,凸显了 Kashan 基因型的基础性作用。尽管该研究并未识别出特定的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),但它加深了我们对菠菜抽薹遗传调控的理解,同时突出了SpCOL14是一个极具潜力、值得进一步深入研究的候选基因。
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