可视化环介导等温扩增技术:快速检测大田鳖环境 DNA 的新利器
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时间:2025年04月30日
来源:Conservation Genetics Resources 0.9
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为解决濒危物种栖息地减少、碎片化导致的种群评估难题,研究人员开发了一种可视化环介导等温扩增(LAMP)技术,用于现场检测大田鳖(Kirkaldyia deyrolli)的环境 DNA(eDNA)。该技术能 30 分钟内快速准确检测,为保护工作提供新方案。
环境 DNA(eDNA)分析是评估濒危物种种群状况和分布的重要工具,这些物种的栖息地不断减少或变得碎片化。在本研究中,开发了一种可视化环介导等温扩增(LAMP)方法,用于在淡水栖息地现场检测大田鳖(Kirkaldyia deyrolli)的 eDNA。基于 K. deyrolli 的线粒体 DNA 序列设计了物种特异性引物,专门靶向细胞色素 C 氧化酶亚基 II(COII)基因。通过浊度和可视化 LAMP 测试证实了这些引物的有效性,证明其具有高特异性和敏感性。利用商用便携式设备进行了现场测试,可在不同池塘现场直接进行 eDNA 提取和可视化 LAMP 反应。结果显示,该方法能在 30 分钟内实现快速准确检测,表明其在快速评估自然栖息地中 K. deyrolli 的存在方面具有潜力。这项技术为实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)提供了一种经济高效且快速的替代方法,直接助力野外的有效保护工作。
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