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为探究非洲不同地区人乳头瘤病毒(HPV)的流行及传播模式,研究人员从 21 个非洲国家的宫颈样本中获取 9203 条 HPV 基因组序列分析。发现非洲 HPV 序列与欧洲有遗传关联,特定基因型常见,部分国家感染率高。该研究有助于了解 HPV 传播规律。
人乳头瘤病毒(Human Papillomavirus,HPV)是一类广泛传播且种类多样的病毒,它可引发多种临床病症,其中就包括宫颈癌,宫颈癌是全球女性中最为常见的癌症之一。在非洲,HPV 基因型的流行率和分布情况在不同地区差异显著。
在这项研究中,研究人员从 GenBank 数据库获取了来自 21 个非洲国家宫颈样本的 9203 条 HPV 分离株的基因组序列,其中 184 条被鉴定为独特序列并用于进一步分析。系统发育分析表明,非洲的 HPV 序列与欧洲的序列存在遗传同源性,而与美洲的分离株亲缘关系较远。迁移分析显示,HPV 的传播存在明显的不对称性,从非洲向欧洲的迁移率始终高于反向迁移率,这表明非洲是进入欧洲的 HPV 基因变异的主要来源地。这种相互关联凸显了历史、地区和文化等多种因素的复杂相互作用,它们共同塑造了非洲 HPV 毒株的基因组特征。
在非洲,HPV 基因型 35、31、16、18、58、45、7 和 66 在不同地区普遍存在。阿尔及利亚、摩洛哥、卢旺达和几内亚的 HPV 基因型较为多样,而刚果共和国和乍得的感染率最高。