探索香茅生物活性化合物:对抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的新希望
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时间:2025年04月30日
来源:In Silico Pharmacology
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为解决筛选抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)植物次生代谢物的问题,研究人员利用香茅精油开展相关研究。通过分子对接、MD 模拟等实验,分析了抗 MRSA 活性及菌株遗传相似性,为开发抗 MRSA 药物提供新思路。
分子对接是基于分子机制值筛选生物活性化合物的有效工具。研究人员尝试利用从当地可得的香茅属(Cymbopogon)物种,如弯叶香茅(C. flexuosus)、爪哇香茅(C. winterianus)和马丁香茅(C. martinii)中提取的精油(EO),鉴定和筛选对抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的植物次生代谢物。首先完成了精油的水蒸馏以及气相色谱 - 质谱(GCMS)表征。然后将文库生成的化合物与青霉素结合蛋白 2a(PBP2a,PDB ID:3ZG5)进行对接。研究人员选择 PBP2a(一种转肽酶)作为靶点,是因为它通过表达使 MRSA 对 β - 内酰胺类抗生素产生高水平耐药性。重要的是,PBP2a 在 β - 内酰胺类抗生素的 “挑战” 下,仍能催化细胞壁交联。研究人员进行了 100 纳秒的分子动力学(MD)模拟,以探究受体 - 配体复合物的稳定性。此外,还针对不同临床分离的 MRSA 进行了抗 MRSA 活性实验,并通过随机扩增多态性 DNA(RAPD)技术分析了 MRSA 分离株之间的遗传相似性,RAPD 技术是一种快速、经济且实用的技术。
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