CNV-Seq 联合传统核型分析：产前诊断染色体异常的新突破

在产前诊断中，为评估拷贝数变异测序（CNV-Seq）检测染色体异常的效果，研究人员对 1001 例样本进行回顾性分析。结果显示 CNV-Seq 检测率更高，能发现更多亚显微改变。该研究为产前诊断提供新依据，意义重大。

　　在生命的奇妙旅程中，新生命的诞生总是充满希望，但也可能隐藏着未知的风险。产前诊断就像一盏明灯，帮助人们提前发现胎儿可能存在的染色体异常和遗传疾病。传统的核型分析技术，在过去几十年里一直是产前细胞遗传学诊断的基石。它能直观地观察整个染色体组，发现非整倍体、大片段的缺失、重复和结构重排等问题 。然而，它也有明显的短板，分辨率有限，只能检测到影响基因组大片段的变化，通常要大于 5 - 10 兆碱基，而且耗时耗力，还依赖细胞培养，一旦细胞生长不佳或受到污染，就可能无法得出结果。染色体微阵列分析（CMA）虽然分辨率更高，能检测到传统核型分析无法发现的亚显微染色体失衡，但它也无法检测平衡易位和低水平的嵌合体，并且对检测到的拷贝数变异（CNVs）的解读也存在挑战。

随着基因组技术的飞速发展，拷贝数变异测序（CNV-Seq）应运而生，为产前诊断带来了新的希望。它结合了微阵列分析的高分辨率和下一代测序（NGS）的全面基因组覆盖优势，不仅能检测更广泛的染色体异常，包括亚显微水平的变化，还能更准确、快速地识别 CNVs。为了进一步探究 CNV-Seq 在产前诊断中的价值，福建省三明市第一医院等机构的研究人员开展了一项回顾性研究 。他们对 2021 年 4 月至 2023 年 12 月期间的 1001 例产前样本进行分析，将 CNV-Seq 与传统核型分析的结果进行对比，并评估不同产前诊断指征下胎儿染色体异常的发生率。该研究成果发表在《BMC Medical Genomics》上，为产前诊断领域提供了重要的参考。

研究人员主要运用了两种关键技术方法。一是核型分析，对羊水样本采用标准化细胞遗传学技术，经过细胞培养、收获，制备中期染色体并进行 G 显带染色，在显微镜下观察染色体结构，依据国际人类细胞遗传学命名系统（ISCN）进行分类和报告。二是 CNV-Seq，从羊水样本中提取基因组 DNA，构建测序文库，在 MGISEQ - 2000 平台测序，对数据进行质量控制、序列比对，利用 EXCAVATOR 算法识别 CNVs，并与公共数据库比对评估致病性 。研究样本来自福建省某医院产前诊断单元进行侵入性产前诊断的 1685 例胎儿，从中选取 1001 例 CNV-Seq 结果异常的样本进行回顾性分析。

下面来看看具体的研究结果：

1. 患者特征：研究涵盖 1001 名孕妇，平均年龄 34.4 岁，平均孕周 19⁺⁶周。胎儿采样的主要指征包括超声检测出胎儿异常（10.5%）、唐筛高危（38.8%）、高龄产妇（40.1%）、无创产前检测（NIPT）提示部分染色体重复或缺失（4.0%）等。
2. CNV-Seq 检测结果：在 1001 例胎儿样本中，3.6% 存在全染色体非整倍体，5.3% 存在致病性 CNVs，这些 CNVs 大小在 107 kb 至 40.75 Mb 之间，涉及 33 种已知综合征，如 DiGeorge 综合征、22q11.2 微重复综合征等。
3. CNV-Seq 与核型分析的比较：整体上，CNV-Seq 的检测率为 8.9%，高于核型分析的 5.0%。在高危 NIPT 和高危唐筛等特定诊断类别中，CNV-Seq 表现更优。CNV-Seq 能检测出核型分析发现的所有异常，还额外发现 47 个核型分析无法检测的微缺失和微重复，但它无法检测核型分析发现的平衡易位，对嵌合体的检测能力也有限。
4. 临床随访：958 例有随访结果的病例中，CNV-Seq 检测出染色体异常的 88 例胎儿中，63 例妊娠终止，其中 31 例为染色体非整倍体，32 例为致病性 CNVs。对于意义不明的变异（VUS），多数孕妇在确认无相关疾病表型后继续妊娠，少数因潜在风险终止妊娠。

综合研究结果和讨论部分，CNV-Seq 在产前诊断中展现出强大的优势，其检测率高于传统核型分析，尤其在检测亚显微染色体异常方面表现突出，能为临床提供更多遗传信息，有助于医生和孕妇做出更合理的决策。不过，CNV-Seq 也存在局限性，如无法检测平衡染色体重排。因此，联合使用 CNV-Seq 和核型分析，能提高染色体异常的整体检测率，为产前诊断提供更全面的评估。这项研究不仅为临床实践提供了重要指导，也推动了产前诊断技术的进一步发展，让人们在迎接新生命的道路上，能更准确地识别风险，为新生命的健康保驾护航。