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结直肠癌(CRC)死亡率高,转移和血管生成机制不明。研究人员聚焦 DDX21 开展研究,发现 DDX21 通过与 SIRT7 竞争性结合,上调 NAT10,增强 ac4C 修饰,促进 CRC 转移和血管生成,为 CRC 治疗提供新靶点。
结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)是全球范围内常见的恶性肿瘤,严重威胁人类健康。近年来,尽管 CRC 的诊疗手段不断发展,如筛查、新辅助化疗和手术等的应用,一定程度上改善了患者的治疗效果,但患者的预后依旧不佳,转移和血管生成是导致高死亡率的关键因素。转移使得癌细胞扩散至远处器官,而血管生成构建的异常血管网络为癌细胞转移创造了条件,二者紧密关联,在 CRC 的进展过程中起着决定性作用。因此,深入探究 CRC 转移和血管生成的分子机制,成为攻克这一难题的关键,也为开发更有效的治疗策略带来了希望。
在这样的背景下,徐州医科大学附属医院的研究人员展开了相关研究。他们发现 DExD - box 解旋酶 21(DDX21)在 CRC 中发挥着重要作用,相关研究成果发表在《Cell Death and Disease》杂志上。
研究人员运用了多种关键技术方法。在样本方面,收集了徐州医科大学附属医院的 CRC 及相应癌旁组织样本。实验技术上,利用 RNA 免疫沉淀(RIP)探究 RNA 与蛋白的相互作用;通过染色质免疫沉淀(ChIP)分析蛋白与 DNA 的结合情况;开展体内实验,构建小鼠转移模型和皮下异种移植瘤模型,直观观察肿瘤的发展和转移情况 。
下面来看看具体的研究结果。
- DDX21 在 CRC 中过表达且与不良预后相关:研究人员通过分析 TCGA 数据库和 GEPIA 数据集,发现 DDX21 在 CRC 中表达上调。免疫荧光(IF)、免疫组化(IHC)和 qRT - PCR 检测进一步证实,DDX21 在 CRC 组织和细胞系中的表达显著高于正常组织和细胞。同时,高表达的 DDX21 与肿瘤直径、侵袭深度、淋巴结转移、远处转移及 TNM 分期呈正相关,且与患者的不良总生存期(OS)相关,表明 DDX21 在 CRC 进展中起促癌作用。
- DDX21 促进 CRC 体内转移和血管生成:在体内实验中,研究人员将沉默 DDX21 的 HCT116 细胞(sh - DDX21)和阴性对照细胞(sh - NC)分别注入裸鼠尾静脉或脾脏。PET - CT 检测显示,sh - NC 组小鼠肺和肝的转移信号更强,18F - FDG 摄取更高,且肺和肝的转移结节更多。构建皮下异种移植瘤模型发现,敲低 DDX21 显著抑制肿瘤生长,降低血管侵袭。这些结果表明,DDX21 促进 CRC 体内转移和血管生成。
- DDX21 促进 CRC 体外转移和血管生成:研究人员构建了 DDX21 敲低和过表达的 CRC 细胞系,通过 Transwell 实验、伤口愈合实验和管形成实验发现,DDX21 沉默抑制 CRC 细胞的转移和血管生成能力,而过表达则增强这些能力。此外,用 DDX21 过表达或敲低的 CRC 细胞上清处理人脐静脉内皮细胞(HUVECs),MTT 实验和 ELISA 实验证实 DDX21 促进 HUVECs 增殖和血管内皮生长因子(VEGF)表达,进一步表明 DDX21 在 CRC 体外转移和血管生成中起促进作用。
- DDX21 通过 NAT10 促进 CRC 转移和血管生成:RNA 测序(RNA - seq)和生物信息学分析显示,N - 乙酰基转移酶 10(NAT10)是 DDX21 的潜在靶点。qRT - PCR 和 Western blotting 结果表明,DDX21 调控 NAT10 的表达。拯救实验发现,敲低 NAT10 可逆转 DDX21 对 CRC 细胞迁移、侵袭和管形成的促进作用。此外,NAT10 在 CRC 中表达上调,其增强 CRC 转移和血管生成,且 DDX21 通过 NAT10 介导的 ac4C 修饰促进 CRC 转移和血管生成,敲低 NAT10 可抑制体内肿瘤生长和转移。
- DDX21 通过 NAT10 介导的 ac4C 修饰增强 mRNA 稳定性:乙酰化 RNA 免疫沉淀测序(acRIP - seq)和 NAT10 - RNA - seq 分析发现,ac4C 修饰广泛分布于转录组,主要富集在 mRNA 的 3’UTR 和 CDS 区域,NAT10 敲低影响这些区域的修饰。整合分析筛选出 ATAD2、SOX4 和 SNX5 等受 DDX21 和 NAT10 调控的基因,它们与肿瘤转移和血管生成相关。NAT10 - RIP - qPCR、acRIP - qPCR 和 qRT - PCR 等实验表明,DDX21 通过 NAT10 介导的 ac4C 修饰增强 ATAD2、SOX4 和 SNX5 的 mRNA 稳定性,促进其表达。
- DDX21 通过竞争性结合 SIRT7 的催化结构域促进 NAT10 转录:基因集富集分析(GSEA)和 IF 实验表明,DDX21 转录激活 NAT10 表达,且不依赖其 RNA 解旋酶活性。通过 Co - IP、质谱分析和一系列实验,研究人员发现 DDX21 与 SIRT7 相互作用,竞争性结合 SIRT7 的催化结构域(CA 结构域),阻断 SIRT7 介导的 NAT10 启动子 H3K18 去乙酰化,从而促进 NAT10 表达。
综合上述研究,研究人员得出结论:DDX21 在 CRC 中显著上调,通过竞争性结合 SIRT7 的 CA 结构域,阻断 SIRT7 对 NAT10 转录的抑制作用,使 NAT10 表达上调。上调的 NAT10 重塑致癌基因 ATAD2、SOX4 和 SNX5 的 mRNA 的 ac4C 修饰,增强其稳定性,促进基因表达,进而诱导 CRC 转移和血管生成。该研究揭示了 DDX21/NAT10 介导的 mRNA 稳定性调控机制在 CRC 中的重要作用,为将 DDX21 作为治疗靶点克服 CRC 转移和血管生成提供了理论依据,为 CRC 的治疗开辟了新的方向,有望推动相关靶向治疗药物的研发,改善 CRC 患者的预后 。