囊性纤维化患者铜绿假单胞菌感染的新型噬菌体WRAIR_EPa83/EPa87全基因组解析及治疗潜力

【字体: 时间:2025年04月30日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7

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  来自美国陆军沃尔特·里德研究所的研究团队针对耐药性铜绿假单胞菌(Pa)引发的囊性纤维化感染难题,完成了噬菌体鸡尾酒疗法关键组分——布鲁诺病毒属(Bruynoghevirus)噬菌体WRAIR_EPa83/EPa87的全基因组测序。两株噬菌体基因组长度分别为45,622/45,077 bp,GC含量52.52%/52.11%,携带81/80个CDS和2-3个tRNA基因,经BACPHLIP预测为裂解性噬菌体,具备临床转化潜力。

  

在应对囊性纤维化患者耐药性铜绿假单胞菌(Pa)感染的攻坚战中,科学界将目光投向了噬菌体疗法。最新研究揭示了两种布鲁诺病毒属(Bruynoghevirus)噬菌体WRAIR_EPa83和WRAIR_EPa87的基因组奥秘——这对"细菌猎手"的基因组长度分别为45,622bp和45,077bp,GC含量分别为52.52%和52.11%,分别编码81和80个功能蛋白,并携带2-3个tRNA基因。

这些噬菌体是从华盛顿特区(坐标38.819362, -77.022137)的污水样本中分离得到的"特种兵",经过三重噬菌斑纯化培养后,采用Illumina MiSeq平台完成测序。数据分析显示其基因组末端存在183-184bp的直接重复序列,通过PhageTerm软件确认了其"分子身份证"。令人振奋的是,BACPHLIP软件以99.95%和92.37%的高置信度预测它们为裂解性噬菌体,且未检测到溶原性相关基因或抗生素耐药因子。

作为正在开展I/II期临床试验的WRAIR-PAM-CF1四联噬菌体鸡尾酒疗法的重要成员,这两株噬菌体与已知布鲁诺病毒属参考基因组相比,全基因组平均核苷酸相似性(wgANI)介于59.47%-92.30%之间。基因组比对图谱显示它们在结构蛋白、裂解模块和复制模块上呈现高度保守性,就像配备了标准化的"分子武器库"。特别值得注意的是,它们与已报道的同类噬菌体类似,具有广谱抗菌活性和强大的抗生物膜能力,这为攻克囊性纤维化患者的顽固性肺部感染提供了新的"生物导弹"。

该研究获得美国国防部医学研究项目的资助,所有实验菌株均由沃尔特·里德陆军研究所的多重耐药菌株库提供。这些发现不仅丰富了噬菌体资源库,更为临床转化应用奠定了分子基础,标志着噬菌体疗法在对抗超级细菌的战场上又迈出了关键一步。

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