龋齿致病菌 Streptococcus mutans GDP01 全基因组解析：印度儿童分离株的分子特征与致病机制

来自印度Madurai地区的研究人员针对龋齿主要致病菌 Streptococcus mutans 开展全基因组测序研究，成功分离GDP01菌株并完成199 Mb基因组组装（GC含量36.7%）。该研究通过Illumina HiSeq 4000测序和Unicycler组装技术，鉴定出1,883个编码基因及毒力因子（spaP/luxS/ldh），为揭示龋齿发病机制提供重要分子基础。

　　

作为龋齿主要元凶的革兰阳性球菌 Streptococcus mutans（S. mutans），其GDP01分离株在印度Madurai地区10-19岁龋齿儿童口腔中被成功捕获。研究人员采用无菌棉签采样后，通过脑心浸液琼脂（BHI）培养和Xploregen试剂盒提取基因组DNA，经Illumina HiSeq 4000平台产生642万条151 bp双端 reads，测序深度达482.34倍。

基因组拼图游戏在Unicycler v0.4.8的助力下完成，呈现单条199 Mb的染色体图谱（GC含量36.7%），N₅₀达329,832 bp。毒力因子数据库(VFDB)挖掘揭示该菌株携带三大"犯罪工具"：黏附蛋白spaP、生物膜调控因子luxS和产酸关键酶ldh。有趣的是，基因组中未发现非致病性适应基因，暗示其"专职致龋"的特性。

通过FastANI比对，GDP01与标准株UA159的相似度达99.2%，而rRNA、tRNA等看家基因的完整分布（3+30+1）进一步佐证其身份。研究不仅绘制了首张印度儿童龋源S. mutans基因组图谱，更为靶向阻断致龋通路（如生物膜形成/产酸代谢）提供了精准分子靶点。