工程化细胞外囊泡:实现多模式治疗药物高效细胞内递送的新突破

【字体: 时间:2025年04月30日 来源:Nature Communications 14.7

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  为解决蛋白质和 RNA 治疗药物细胞内递送难题,研究人员开展了工程化细胞外囊泡(EVs)的研究。他们构建了 VEDIC 和 VFIC 系统,实现高效细胞内蛋白递送及基因编辑,还可治疗 LPS 诱导的炎症,为疾病治疗提供新策略。

  在生命科学和医学领域,蛋白质和 RNA 治疗药物具有独特的疾病治疗潜力,然而其细胞内递送却困难重重。细胞膜天生的不可渗透性,使得众多传统递送策略纷纷碰壁。像 iTOP 系统,虽能在体外实现蛋白质向原代细胞的高效递送,但在体内却 “有心无力”;细胞穿透肽(CPPs)在某些应用中初露锋芒,却因内体截留和潜在毒性问题而受限;各类纳米载体,如脂质纳米颗粒和聚合物,同样存在与 CPPs 类似的弊端,且合成性质可能引发体内副作用 。
在此背景下,来自瑞典卡罗林斯卡学院(Karolinska Institutet)等多个研究机构的科研人员开启了探索之旅,致力于找到突破细胞内递送困境的有效方法。他们将目光聚焦于细胞外囊泡(EVs),这是一种由脂质双分子层包裹的颗粒,能在细胞间传递生物活性分子,有望成为理想的递送载体。不过,利用 EVs 实现蛋白质的高效细胞内递送面临两大挑战:一是如何在 EVs 内部富集可溶且有活性的治疗性蛋白质;二是怎样让治疗性蛋白质从内体高效逃逸进入靶细胞胞质。
为攻克这些难题,研究人员精心设计并构建了两种创新系统 ——VEDIC(VSV-G plus EV-Sorting Domain-Intein-Cargo)系统和 VFIC(VSV-G-Foldon-Intein-Cre)系统。该研究成果发表在《Nature Communications》上,为蛋白质和 RNA 治疗药物的细胞内递送带来了新曙光。
研究人员运用了多种关键技术方法。在细胞模型构建方面,利用多种报告细胞系(如 Traffic Light(TL)荧光 Cre 报告细胞、CRISPR 报告细胞等)来评估 EVs 的递送效率。在 EVs 的制备与纯化上,通过转染相关质粒,借助瞬时转染技术使 HEK293T 细胞产生 EVs,随后采用切向流过滤(TFF)、尺寸排阻色谱(SEC)和密度梯度超速离心(DGUC)等方法进行分离纯化 。此外,运用多种检测技术,如流式细胞术、共聚焦显微镜、蛋白质免疫印迹(Western blot)分析等,对 EVs 的功能、蛋白质表达水平及细胞内定位等进行全面检测。

开发 VEDIC 系统实现高效细胞内蛋白质递送


研究人员借助 Traffic Light(TL)荧光 Cre 报告细胞评估 EVs 递送功能蛋白的潜力。实验发现,单独的 Cre、CD63 - Cre、CD63 - Intein - Cre 或 Intein - Cre 过表达细胞产生的 EVs 均无法诱导报告细胞发生重组。经筛选 40 种人类和病毒来源的融合蛋白后,发现病毒融合蛋白 VSV - G 与 CD63 - Intein - Cre 共转染可显著提升 Cre 递送效率,由此构建了 VEDIC 系统。该系统在多种细胞系中呈现剂量依赖性重组,在难转染细胞系中也能实现有效重组,且经 SEC 纯化后仍能保持活性,与已发表的 Nanoblade VLP 系统相比,在部分细胞系中表现更优 。在共培养实验中,无论是直接共培养、IBIDI 共培养还是 Transwell 实验,VEDIC 系统均能使受体细胞发生显著重组。

开发 VFIC 系统进一步提升细胞内蛋白质递送效率


为优化 VEDIC 系统,研究人员尝试将关键组件整合到单个构建体中。实验表明,VSV - G 可作为有效的 EV 加载蛋白,基于此构建了 VSV - G - Intein - Cre 和 VSV - G - Foldon - Intein - Cre(VFIC)融合蛋白。实验显示,VFIC 系统在报告细胞中呈现剂量依赖性重组,在低剂量实验中表现更优,且在难转染细胞中也能有效介导重组。经 SEC 或 DGUC 纯化后,VFIC EVs 仍保持高效的 Cre 递送能力,在共培养实验中同样能使受体细胞发生显著重组。

pH 敏感型内含肽在 EV 生物发生过程中进行 C 末端切割


研究人员为验证所用内含肽在 pH 依赖方式下进行 C 末端切割,引入了 H439Q 和 N440A 两个突变体。Western blot 结果显示,突变体的切割率与预期相符,功能实验表明,含突变体的 VEDIC 和 VFIC 系统在报告细胞中的重组率显著降低,证实了内含肽在 EV 生物发生过程中能以 pH 依赖方式进行 C 末端切割,形成可溶性货物蛋白。

VSV - G 促进受体细胞内受体介导的内吞后内体逃逸


为明确 VSV - G 在内体逃逸和内吞作用中的角色,研究人员引入了破坏融合(P127D)或 LDL - R 受体结合能力(K47Q)的突变体。通过共聚焦显微镜观察发现,VSV - G 能促进货物从内体逃逸进入胞质,而突变体则导致货物在内体截留。蛋白质免疫印迹分析和重组实验表明,突变体的 Cre 递送效率和重组活性显著降低,进一步证实了 VSV - G 在促进内体逃逸中的关键作用。

利用 VEDIC 和 VFIC 系统实现 Cas9/sgRNA RNPs 和靶向 PCSK9 的大范围核酸酶的稳健基因编辑


研究人员将 Cas9 封装到工程化 EVs 中,以 CRISPR 报告细胞评估 Cas9 - RNP 的递送效果。实验观察到,VEDIC 和 VFIC EVs 处理的细胞呈现剂量和时间依赖性的基因编辑,VFIC EVs 的基因编辑效率高达近 80% 。对小鼠转甲状腺素蛋白(mTTR)基因的靶向编辑显示,N2a 细胞经工程化 EVs 处理后,indels 率达 80%。此外,构建的靶向 PCSK9 的 VEDIC 和 VFIC 构建体,能使细胞中 PCSK9 蛋白水平显著降低。

VEDIC 和 VFIC 系统在体内的应用


在体内实验中,研究人员对携带 B16F10 - TL 黑色素瘤异种移植物的小鼠进行瘤内注射,以及对 R26 - LSL - tdTomato 报告小鼠进行脑室内(ICV)注射,均检测到显著的 Cre 介导的重组。利用渗透泵进行 ICV 注射,可使海马体和皮层中分别有高达 40% 和 30% 的细胞被编辑。经腹腔注射后,在肝脏和脾脏中观察到大量 tdTomato 阳性细胞,且在脾脏中发现功能性递送主要发生在白细胞(CD45+),尤其是 T 细胞(CD3+)和巨噬细胞(F4/80+)中 。

治疗脂多糖(LPS)诱导的全身炎症


研究人员运用 VEDIC 和 VFIC EVs 递送 NF - κB 活性超级抑制剂(SR),治疗 LPS 诱导的全身炎症。体外实验表明,SR 能成功抑制 TNF - α 介导的 NF - κB 信号激活。体内实验显示,经 VEDIC 和 VFIC EVs 治疗的小鼠,体重减轻和死亡率显著改善,肝脏、肾脏和肺部的炎症细胞浸润减少,证明了该系统在疾病治疗中的有效性。
研究人员通过开发 VEDIC 和 VFIC 系统,成功突破了 EV 介导的蛋白质治疗药物递送的关键瓶颈,实现了功能蛋白在体外和体内的高效细胞内递送,为治疗多种疾病带来了新希望。这一研究成果不仅在基因编辑领域展现出巨大潜力,有望用于治疗中枢神经系统(CNS)遗传疾病等;还在炎症性疾病治疗方面取得进展,为相关疾病的治疗提供了新的策略和方法,推动了生命科学和健康医学领域的发展。

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